بررسی تنوع ژنتیکی اکوتیپ‎های زیره‎سبز خراسان با استفاده از نشانگرهای پروتئینی

زیره ‌سبز یکی از قدﻳﻤﻲﺗﺮﻳﻦ و از ﻧﻈﺮ اﻗﺘﺼﺎدی مهمترین ﮔﻮﻧﻪ در ﺧﺎﻧﻮاده چتریان است که بالاترین سطح زیر کشت در استان‌های خراسان را دارد. در این تحقیق تنوع ژنتیکی 20 اکوتیپ زیره‎‎سبز با پراکندگی کامل از سه استان خراسان شمالی، رضوی و جنوبی توسط نشانگرهای پروتئینی بررسی گردید. بررسی تغییرات پروتئین‎ با روش sds-page با طی مراحل استخراج پروتیئن از بذر، تعیین غلظت نمونه‎ها و بعد انجام الکتروفورز انجام شد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که بین و درون جمعیت‌ها تنوع وجود داشت. بر اساس نشانگر پروتئینی 24 درصد از تغییرات مربوط به بین جمعیت‎ها و 76 درصد مربوط به‎ درون جمعیت‎ها بود. درصد چندشکلی به‎دست آمده از نشانگر پروتئینی 27 درصد، میانگین محتوای چندشکلی 0.01، میانگین شاخص اطلاعاتی شانون 0.49 و میانگین شاخص اطلاعاتی نی 0.68 به‎دست آمد. نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که سه مولفه اول 83 درصد از تغییرات را توجیه کردند. تجزیه خوشه‌ای بر اساس ماتریس تشابه اکوتیپ‎های مورد مطالعه را در پنج خوشه گروه‌بندی نمود. گروه‌بندی اکوتیپ‌ها نشان داد که تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیّت نمی‌کند.

The study of genetic diversity of cumin ecotypes of Khorasan provinces using protein markers

Cuminum cyminum is one of the oldest and most economically important species in theApiaceae family that has the highest cultivated areas of Khorasan provinces in Iran. Geneticdiversity of 20 ecotypes of Cuminum cyminum was investigated by protein markers. Theecotypes were randomly collected from three provinces of North, Razavi and South Khorasanprovinces. Protein profile analysis was carried out by SDSPAGE method. The methodincluded: extracting protein from the sample seeds, determining samples concentration, andfinally running on electrophoresis gel. Analysis of molecular variance showed that there wasvariation between and within the populations. Based on the protein markers %24 of thevariations belonged to between populations and %76 belonged to within populations.Polymorphism percentage, polymorphic content mean, Shannon's information index and theaverage of Nei's information index were 27%, 0.01, 0.49, and 0.68, respectively. Results ofPCoA showed that the first three components accounted for 83% of the variation. Clusteranalysis based on the similarity matrix classified the studied ecotypes in 5 clusters.