جداسازی و مطالعه بیوانفورماتیکی ژن عامل رونویسی tbjamyc دخیل در بیوسنتز تاکسول از سرخدار گونه ایرانی

داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلی تاکسل از متابولیت های بیوسنتز شده در سرخدار (taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردی ترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبول ها مانع از تقسیم سلولی در بافت های سرطانی می شود. عامل رونویسی jamyc از خانواده myc دارای موتیف متصل شونده به dna به‎نام bhlh می باشد که در سایر گونه های سرخدار شناسایی شده است. هدف از این تحقیق جداسازی و همسانه سازی ژن عامل رونویسی tbjamyc برای اولین بار و تجزیه‌وتحلیل بیوانفورماتیکی آن است. در ابتدا برای به‎دست آوردن گیاهچه های این گیاه رویان از دانه های این گیاه خارج و در محیط کشت ms حاوی زغال فعال و اسیداسکوربیک کشت شد. از rna استخراج شده با کیفیت و کمیت خوب cdna سنتز شد. ژن عامل رونویسی tbjamyc به‎وسیله pcr از cdna و آغازگرهای اختصاصی این ژن تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در ناقل همسانه سازی ptg 19  به‎روش ta کلونینگ همسانه سازی و توالی یابی شد. خانواده پروتئینی و دمین های پروتئین tbjamyc به‎وسیله نرم افزار pfam تعیین شدند. همچنین به‎وسیله نرم افزار modeller ساختار سه بعدی دمین ‏های متصل شونده به dna این پروتئین تجزیه‌وتحلیل و مدل سازی شد. این تجزیه‌وتحلیل‎ها نشان دادند که پروتئین tbjamyc جزء عوامل رونویسی myc حاوی دمین bhlh برای اتصال به dna و تنظیم بیان ژن ها می باشد.