|
|
تعیین تنوع ژنتیکی جمعیت ماهیان گورخری aphanius ginaonis و aphanius dispar در آبهای داخلی هرمزگان و بوشهر با استفاده از نشانگر مولکولیpcr-rflp
|
|
|
|
|
نویسنده
|
سلیمی عصمت ,ذوالقرنین حسین ,ارچنگی بیتا ,رونق محمدتقی ,قاسمی احمد
|
منبع
|
علوم و فنون دريايي - 1397 - دوره : 17 - شماره : 1 - صفحه:1 -9
|
چکیده
|
در این مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت ماهیان گورخری گنو و معمولی با استفاده از روش pcrrflp بررسی گردید. جهت تعیین تنوع ژنتیکی این دو ماهی در حوضه خلیج فارس، تعداد 30 نمونه ماهی گورخری گنو (aphanius ginaonis) از چشمه آب گرم گنو در استان هرمزگان و 30 نمونه ماهی گورخری معمولی (aphanius dispar) از چشمه آب گرم میراحمد در استان بوشهر جمعآوری گردید. جهت هضم آنزیمی محصول pcr به طول 550 جفتباز در ناحیه dloopمیتوکندریایی، از 5 آنزیم محدودگرalui, dpni, eco47i, hindiii hinfi استفاده شد. در نتیجه این آنالیزها، 12 هاپلوتیپ متفاوت به دست آمد که 9 هاپلوتیپ مربوط به ماهی گورخری گنو و 3 هاپلوتیپ مربوط به ماهی گورخری معمولی بود. 4 هاپلوتیپ به دست آمده در ماهی گورخری گنو جزء هاپلوتیپهای نادر بودند. در ماهی گورخری معمولی هاپلوتیپ aaaaa بیشترین فراوانی را دارا بود و در ماهی گورخری گنو هاپلوتیپهای eabab، eacab و cabab بیشترین فراوانی را نشان دادند. میزان تنوع هاپلوتیپی در درون جمعیت نمونه های ماهی a.ginaonis ، 79/0 و در نمونه های ماهی a.dispar ، 3/0 و تنوع نوکلئوتیدی در درون جمعیت نمونه های ماهی a.ginaonis، 19/0 و در نمونه های ماهی a.dispar ، 05/0 محاسبه گردید. محاسبه تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی نشان داد که تنوع در ژنوم میتوکندریایی ماهی گورخری گنو بالاتر از ماهی گورخری معمولی است. بررسیهای انجام شده بر ژنوتیپهای حاصله نشان داد که pcrrflp تکنیک مناسبی جهت تعیین تنوع ژنتیکی در دو گونه ماهی مذکور میباشد.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی، aphanius ginaonis ,aphanius dispar ,pcr-rflp
|
آدرس
|
دانشگاه علوم و فنون دریایی, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه زیستشناسی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه زیستشناسی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه زیستشناسی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی, دانشکده علوم دریایی و اقیانوسی, گروه زیستشناسی دریا, ایران, دانشگاه خلیج فارس بوشهر, مرکز مطالعات و پژوهشهای خلیج فارس, گروه بیولوژی دریا, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Genetics Diversity of Aphanius ginaonis and Aphanius dispar in Hormozghan and Bushehr internal waters using PCR-RFLP Molecular Marker
|
|
|
Authors
|
Salimi Esmat ,zolgharnein hossein ,Archangi Bita ,Ronagh Mohammad Taghi ,Ghasemi Seyyed Ahmad
|
Abstract
|
In this study, two populations of Aphanius ginaonis (Holly, 1929) and Aphanius dispar (Ruppell, 1828) were examined to determine genetic diversity using PCRRFLP technique. A total of 60 individual specimens were collected from Hormozgan and Bushehr internal waters, comprising two sampling sites; from Geno hot spring (30 individuals of A. ginaonis) and Mir Ahmad hot spring (30 individuals of A. dispar). The Dloop region of mitochondrial DNA (550 bp) was amplified using PCR followed by RFLP analysis based on 5 restriction endonucleas enzymes (AluI, DpnI, Eco47I, HindIII HinfI). In order to undertake data analysis, Arlequin 3.11 was applied. Results at population levels indicated that Geno individuals have more haplotype diversity than Mir Ahmad individuals (9 and 3 haplotypes respectively). However, further investigation using genetic techniques is required to clarify the molecular history and evolution of Aphanius species in this area. Results obtained from this research would be applicable to understand conservation genetics and management of this important fish species in Iran.
|
Keywords
|
Aphanius ginaonis ,Aphanius dispar ,PCR-RFLP
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|