|
|
بررسی فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس actiniaria: actiniidae)anemonia بر اساس توالی dna میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس
|
|
|
|
|
نویسنده
|
ذوالقرنین حسین ,حسینی صبا
|
منبع
|
اقيانوس شناسي - 1394 - دوره : 6 - شماره : 24 - صفحه:77 -83
|
چکیده
|
در این مقاله، فیلوژنی مولکولی شقایق دریایی جنس (actiniaria: actiniidae) بر اساس توالی dna میتوکندریایی (coi) در خلیج فارس مورد بررسی قرار گرفت. گونه مورد مطالعه در این تحقیق از جزیره لارک واقع در خلیج فارس جمع آوری شد وdna آن استخراج و قسمتی از ژنcoi آن (حدود 700 جفت باز) با استفاده از دو پرایمرlco1490 وhco2198 به وسیلهpcr تکثیر داده شد و محصولpcr در دستگاه توالی یاب خودکارdna به وسیله شرکتbioneer توالی یابی گردید. توالی نوکلئیک اسید و پروتئین گرفته شده از ژنcoi به عنوان یک توالی جدید در ژن بانک گزارش شد. بر طبق این توالی شقایق خلیج فارس به عنوان یک گونه جدید با نامanemonia sp. pg و شماره ثبتab933643.1 در وب گاهncbi قرار گرفت. هدف از این مطالعه شناسایی مولکولی شقایق خلیج فارس و انجام آنالیز مولکولی روی آن بود. در آنالیز مولکولی توالی قسمتی از ژنcoi میتوکندریایی گونهanemonia sp. pg از خلیج فارس با 15 شقایق دریایی دیگر از بانک ژن که از لحاظ توالی ژنتیکی به گونه مورد بررسی نزدیک هستند مقایسه گردید. گونهmetridium senile به عنوان برون گونه در نظر گرفته شد. بررسی فیلوژنتیکی بر اساس آنالیزneighborjoining رابطه خواهری بین گونهanemonia sp. pg از ایران و گونهanemonia sp. anem را نشان داد ولی روابط منوفایلتیک بین خانواده های شقایق دریایی را نشان نداد.
|
کلیدواژه
|
شقایق دریایی، فیلوژنتیک، شناسایی مولکولی، خلیج فارس، ،coi
|
آدرس
|
دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوس شناسی, گروه بیولوژی دریا, ایران, دانشگاه علوم و فنون دریایی خرمشهر, دانشکده علوم دریایی و اقیانوس شناسی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
saba.hoseyny@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Molecular Phylogeny Study of the Sea Anemone Genus Anemonia (Actiniaria: Actiniidae) Based on Mitochondrial (COI) DNA Sequences in the Persian Gulf
|
|
|
Authors
|
Zolgharnein Hosein ,Hoseini Saba
|
Abstract
|
Sea anemones (order: Actiniaria) are a subclass of Hexacorallia. They are very varied and are organisms with a simple skeletal polyp. The specie in this study was collected from Larak Island in the Persian Gulf. DNA was extracted from the sle and a part of mtDNA COI gene was lified. Two pairs of primers were designed to lify a final target of 600 bp using PCR method which the product was successively sequenced. The purpose of this study was the molecular identification of the Persian Gulf sea anemone. The nucleotide and protein sequences obtained from this anemonersquo s COI gene were annotated in NCBI Gene Bank as Anemonia sp. PG, the PG standing for the Persian Gulf. Phylogenetic studies were performed to compare the partial sequences of COI genes of 16 sea anemones (order: Actiniaria) with the newly identified anemone (Anemonia sp. PG). Phylogenetic studies based on NeighborJoining analysis showed sister relations between Anemonia sp. PG species from Iran and Anemonia sp. Anem species but did not show monophyletic relationships between sea anemone families.
|
Keywords
|
Sea anemone ,Phylogenetic ,Molecular identification ,COI ,Persian Gulf. ,COI
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|