بررسی ساختار ژنتیکی ماهی صبور (tenualosa ilisha) آب های خلیج فارس و ساحل غربی مالزی با استفاده از توالی یابی ژنوم میتوکندری

مقاله حاضر به منظور ارزیابی ذخایر ژنتیکی ماهی صبور (tenualosa ilisha) انجام شد. نواحی مورد نظر از سواحل ایرانی خلیج فارس (استان های خوزستان و بوشهر) و ایستگاه ساحل غربی مالزی به عنوان برون گروه انتخاب گردیدند. ابتدا آنالیز ژنوم میتوکندری از ناحیه dloop برای تعداد ٨٦ نمونه از گونه مذکور انجام گرفت. سپس قطعات تکثیر شده توالی یابی گردیده و آنالیز ژنتیکی با استفاده از نرم افزارهای bioedit، mega 6 و arlequin انجام شد. نتایج نشان داد که چندین زیر جمعیت از ماهی صبور در منطقه خوزستان حضور دارند. کمترین میزان fst در بین ایستگاه های سواحل خوزستان (fst= 0) و بیشترین میزان fst بین ایستگاه بوشهر با ساحل غربی مالزی به دست آمد ( ٦٤ /٠ = fst ). درخت فیلوژنی upgma نشان داد که جمعیت انتخاب شده از ساحل غربی مالزی تمایز ژنتیکی بالایی نسبت به جمعیت بزرگ سواحل ایرانی دارند و دو گروه نمونه های ایران و مالزی نهایتا در یک شاخه فیلوژنی قرار می گیرند.

Genetic Stock Assessment of Tenualosa ilisha of Persian Gulf Waters and Western Coast of Malaysia Using MtDNA Genome Sequencing

In this research, genetic stock assessment of Hilsa shad Tenualosa ilisha was undertaken from natural distribution of species including rivers and southern coasts of Khuzestan, Bushehr and one sling area from western coast of Malaysia as an outgroup. For this purpose, analysis of MtDNA genome of Dloop region was carried out for 86 sles of Hilsa shad. Then lified fragments were automated sequenced and genetic analysis was done using genetic softwares including BioEdit, MEGA and Arlequin. Results showed that there were several subpopulations of Tenualosa ilisha at least in Khuzestan waters including rivers, estuaries and marine areas. In addition, the minimum Fst (Fst= 0) was in Khuzestan selected sites while maximum Fst (Fst =0.64) was observed in Bushehr and western coast of Malaysia. Phylogenetic analysis showed that Hilsa shad sles originated from western coasts of Malaysia represents higher levels of genetic differentiation compared to subpopulations of this species inhabited in Iranian waters. However, both Malaysian and Iranian Tenualosa ilisha occupy the same place on phylogenetic tree.