بررسی فعالیت ضدمیکروبی و شناسایی مولکولی nocardiopsis sp. aha2 از رسوبات ساحل بندر دیلم، خلیج فارس

بررسی فعالیت ضدمیکروبی و شناسایی مولکولی nocardiopsis sp. aha2 از رسوبات ساحل بندر دیلم است. نمونه برداری در مهرماه 1393 از رسوبات بین جزر و مدی ساحل دیلم انجام شد. شناسایی جنس nocardiopsis با استفاده از تکثیر و توالییابی ژن 16 sr rna انجام گردید. ارزیابی فعالیت ضدمیکروبی با استفاده از روش ایجاد چاهک صورت گرفت. نتایج آزمون افتراقی نشان دادند که nocardiopsis sp. aha2 برای آزمون های کاتالاز و گرم مثبت است و برای سایر آزمونها منفی می باشد. همچنین نتایج آزمون sim نشان دادند که این ایزوله غیرمتحرک است. از طرف دیگر، نتایج فعالیت ضدمیکروبی نشان دادند که این ایزوله، نسبت به فعالیت ضدباکتریی، فعالیت ضدقارچی بهتری دارد. بررسی هاله مهار رشد در فعالیت ضدباکتریایی نشان داد که متابولیت های ایزوله مورد مطالعه، تنها علیه باکتریهای بیماریزای salmonella sp. (قطر هاله، 8/86 میلیمتر) و bacillus cereus (قطر هاله، 7/9 میلیمتر) موثر هستند. همچنین فعالیت ضدقارچی نشان داد که بیشترین اثر مهار رشد علیه قارچ بیماری زای aspergillus flavus با قطر هاله، 14/4 میلیمتر است. بر اساس نتایج این تحقیق، رسوبات ساحل دیلم دارای گونه های کمیاب از گروه اکتینومیست ها هستند که میتوان از آنها به عنوان منابع غنی از ترکیبات فعال زیستی استفاده نمود.

Antimicrobial Activity and Molecular Identification of Nocardiopsis sp. AHA2 from Deylam Nearshore Sediments

The aim of this study was identification and antimicrobial activity examination of Nocardiopsis sp. isolated from Deylam nearshore sediments. Samples were collected from Deylam nearshore sediments on the late September 2014. Identification was done using 16Sr RNA analysis. Antimicrobial assay of the bacterial extracts was performed using standard well diffusion assay. Nocardiopsis was isolated and identified according to amplification and sequencing of 16Sr RNA gene. Differential analyses results for catalase and Gram test were positive and for other tests were negative. Antimicrobial assays showed that the sample had more antifungal activity than antibacterial activity against tested pathogenic microbes. Antibacterial activity results showed that the metabolites extracted from samples were active against Salmonella sp. (inhibition zone, 8.86 mm) and Bacillus cereus (inhibition zone, 7.9 mm). Antifungal activity analysis demonstrated that more inhibition zone was observed against Aspergillus flavus (14.4 mm). The results of this investigation revealed that Deylam nearshore sediments were a rich source of rare actinomycetes which produced bioactive compounds.