|
|
ارتباط میان استعداد ابتلا به سرطان معده و برخی واریانتهای تکنوکلئوتیدی میکروrnaها در جمعیت عمومی استان اردبیل
|
|
|
|
|
نویسنده
|
اخوان آق قلعه هما ,رنجی نجمه ,حبیب اللهی هادی
|
منبع
|
مجله دانشگاه علوم پزشكي اردبيل - 1400 - دوره : 21 - شماره : 1 - صفحه:76 -89
|
چکیده
|
زمینه و هدف: سرطان معده چهارمین سرطان شایع در جهان بوده و استان اردبیل از نظر شیوع سرطان معده در ردههای بالای جهانی قرار دارد. میکروrnaها ملکولهای rna غیر کد کننده با طول 18 تا 21 نوکلئوتید بوده و به علت دارا بودن نقش تنظیمی در سطوح پس از بیان ژنی، دچار تغییرات عملکردی ناشی از تغییرات تک نوکلئوتیدی میگردند. تغییرات توالیایی ژنی mirnaها میتواند منجر به اعطای استعداد سرطانزایی گردد.روش کار: پس از استخراج dna ژنومی از لکوسیت های خون محیطی 150 فرد سالم، ساکن و متولد استان اردبیل، وجود 30 واریانت تک نوکلئوتیدی مستعدکننده به سرطان در ژنهای mirnaها با روشwhole exome sequencing (wes) مورد بررسی قرار گرفت. نتایج بدست آمده توسط روش sangerbased pcrsequencing مورد ارزیابی قرار گرفتند. روش آماری همبستگی پیرسون جهت بررسی اختلاف آماری فراوانی جمعیتی استفاده گردید.یافته ها: پس از تایید نتایج wes، مقایسه فراوانی جمعیتی واریانت های منتخب با جمعیت های عمومی ایران، اروپا و جهان انجام و بر اساس نرخ استاندارد شده بر اساس سن (asr)، شش واریانت واجد اختلاف معنی دار شامل rs10061133، rs12220909، rs12983273، rs2292832، rs2505901 و rs6505162 مشاهده گردیدند. نتیجه گیری: با توجه به وجود گزارشات متعدد مبنی بر ارتباط میان واریانتهای rs10061133، rs12220909، rs12983273، rs2292832، rs2505901 و rs6505162 با سرطان معده درمطالعات مورد شاهدی در نقاط مختلف جهان و جمعیتهای متفاوت، اختلاف آماری بدست آمده میتواند بیانگر وجود استعداد ژنومی جمعیت استان اردبیل برای ابتلا به سرطان معده باشد.
|
کلیدواژه
|
سرطان معده، اردبیل، میکروrna، تغییرات تک نوکلئوتیدی، wes
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد رشت, دانشکده علوم, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد رشت, دانشکده علوم, گروه زیست شناسی, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد رشت, دانشکده علوم, گروه زیست شناسی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
The Relationship between Gastric Carcinogenesis Susceptibility and Some SNPs in MicroRNA Genes in General Population of Ardabil Province
|
|
|
Authors
|
Akhavan Aghghaleh Homa ,Ranji Najmeh ,Habibollahi Hadi
|
Abstract
|
Background & Objectives: Gastric cancer is the fourth most common cancer in the world and Ardabil province is in the top ranks in the world. MicroRNAs are noncoding RNA molecules with a length of 18 to 21 nucleotides and due to their regulatory role in post transcriptional gene expression; single nucleotide polymorphisms (SNPs) could affect their function on target genes regulation.Methods: Genomic DNA was extracted from peripheral blood of 150 healthy volunteers, which were born and living in Ardabil province, 30 SNPs in microRNA genes have been detected by the Whole Exome Sequencing assay. Then, the obtained results were evaluated using Sangerbased PCRSequencing method. The Pearson correlation test was used for finding significant relationships.Results: After confirming the WES results, the population frequency of the selected variants was compared with the general populations of Iran, Europe and the world. Based on the agestandardized rate (ASR), six variants with significant differences, including rs10061133, rs12220909, rs12983273, rs2292832, rs2505901 and rs6505162 were observed.Conclusion: According to the previous casecontrol studies which indicate the association between the variants rs10061133, rs12220909, rs12983273, rs2505901, and rs6505162 and gastric carcinogenesis in various populations, the observed significant differences in our population could imply on the presence of the cancer susceptibility in Ardabil province.
|
Keywords
|
Gastric Cancer ,Ardabil ,MicroRNA ,SNPs ,WES
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|