مدل سازی برهمکنش دارو آلبومین عوامل ضد قارچی: یک مطالعه موردی

زمینه و هدف: برهمکنش آلبومین (به عنوان مهمترین پروتئین پلاسما) با داروهای مختلف باعث ایجاد تغییرات فارماکوکینتیکی می‫شود. از آنجایی که تعامل داروهای مختلف با آلبومین در تعیین دوز و پیش بینی تداخلات داروها و دارو با غذا تعیین کننده است، مطالعه در مورد توانایی اتصال داروهای مختلف به آلبومین زمینه مطالعاتی بسیار مهمی محسوب می باشد. روش کار: داکینگ توسط الگوریتم ژنتیکی لامارکین گنجانده شده در نرم افزار اتوداک 4.2 انجام گرفت. ساختارهای سه بعدی آلبومین با استفاده از پایگاه اطلاعاتی بروک هاون (2bxd & 2bxf; www.rcsb.org) به دست آمدند. آماده سازی فایل‫های مولکول‫ها توسط روش am1 و نرم افزار autodock tools انجام شد.روش بهینه سازی am1 با استفاده از الگوریتم polak ribiere (conjugate gradient) با شرایط نهایی گرادیان rms 0.1 kcal / a mol انجام شد. برهمکنش‫های دارو آلبومین توسط نرم افزار لیگ پلات نشان داده شد.یافته ها: اُکسیکونازول و فنتیکونازول به ترتیب قوی ترین اتصال را به سایت های 1 (iia) و 2 (iiia) آلبومین از خود نشان دادند (انرژی آزاد اتصال 9/01 -و 9/89- کیلو کالری بر مول). لوسین 238 و آلانین 291 اسیدهای آمینه کلیدی در اتصال به سایت 1 و ایزولوسین 388، آسپارژین 391 و لوسین 430 مهم ترین اسیدهای آمینه در اتصال به سایت 2 بودند. نتیجه گیری: یافته های این مطالعه نشان داد که احتمالاً ضد قارچ ها تمایل بالاتری برای اتصال به سایت 2 آلبومین دارند. مقادیر نسبتاً بالای انرژی آزاد اتصال داروهای ضد قارچ به آلبومین لزوم بررسی‫های بیشتر در زمینه مقایسه قدرت اتصال داروهای ضد قارچ و سایر داروها با آلبومین را مطرح می‫سازد. همچنین نتایج به دست آمده حاکی از این مطلب هستند که در اتصال داروهای ضد قارچ به آلبومین، برهمکنش‫های هیدروفوبی مهم تر از پیوندهای هیدروژنی هستند.