بررسی ارزش پیش‌ آگهی و بیان ژن trip13 در سرطان معده

هدف: سرطان معده یک مشکل عمده برای سلامت عمومی در سراسر جهان است. عواملی که باعث به‌وجود آمدن این سرطان می‌شوند به خوبی شناخته نشده‌اند، اگرچه مشخص شده است که بیان نابه‌جای ژن‌ها با این سرطان در ارتباط می‌باشد. trip13 نقش‌های بسیار مهمی در نوترکیبی میوزی، ترمیم dna و پیشرفت چرخه سلولی دارد. شواهد رو به رشدی نشان می‌دهند که trip13 ممکن است عملکردهای دیگری به غیر از میوز و میتوز داشته باشد، یکی از این عملکردها تنظیم تومورزایی است. هدف مطالعه حاضر مقایسه میزان بیان ژن trip13 در بافت‌های تومور و حاشیه تومور معده و ارزیابی ارزش بالینی آن در تحلیل میزان بقاء و پیش‌آگهی بیماران مبتلا به سرطان معده می‌باشد. مواد و روش‌ها: در این مطالعه 50 جفت بافت توموری و حاشیه آن از بیماران مبتلا به سرطان معده جمع‌آوری گردید. ابتدا بیان نسبی ژن trip13 با استفاده از تکنیک qrt-pcr سنجیده و با استفاده از روش δδct-2 کمی‌سازی شد. در ادامه با استفاده از رویکردهای بیوانفورماتیکی و آنالیز پایگاه داده‌ها میزان بیان ژن trip13 در دو کوهورت مختلف از بیماران مبتلا به سرطان معده بررسی شد. هم‌چنین یک مطالعه داده کاوی به منظور بررسی نقش بیان trip13 در پیش‌آگهی بیماران مبتلا به سرطان معده انجام شد. در نهایت ارتباط بین میزان بیان و تعداد نسخه ژن trip13 با استفاده از آنالیز داده‌های پایگاه ccle به دست آمد. یافته‌ها: میانگین بیان ژن trip13 در نمونه‌های توموری بیماران نسبت به نمونه‌های بافت حاشیه‌ای افزایش 2/5 برابری نشان داد. این یافته در آنالیزهای بیوانفورماتیکی نیز تکرار شد و بیان ژن trip13 در هر دو کوهورت بیماران افزایش معنی‌داری نشان داد. بررسی هم‌بستگی میزان بیان ژن trip13 و تعداد نسخه‌های آن در 37 رده سلولی سرطان معده نشان داد که میزان بیان این ژن ارتباط معنی‌داری با تعداد نسخه‌های آن دارد. هم‌چنین هم‌بستگی منفی بین بیان بالای ژن trip13 و بقاء کلی بیماران مبتلا به سرطان معده مشاهده گردید.نتیجه‌گیری: ژن trip13 می‌تواند به عنوان یک بیومارکر پیش‌آگهی‌دهنده امیدبخش و یک هدف درمانی احتمالی در تشخیص و درمان سرطان معده مطرح باشد. 

evaluation of the prognostic value and trip13 gene expression in gastric cancer

introduction: gastric cancer is a major public health issue worldwide. the factors that initiate cancer are not well understood, however aberrant expression of genes is associated with this cancer. trip13 plays pivotal roles in meiotic recombination, dna repair, and cell cycle progression. an increasing body of evidence suggests that trip13 may possess functions other than meiosis and mitosis, particularly in the regulation of tumorigenicity. this study aimed to compare the expression of the trip13 gene in cancerous and adjacent tissue of gastric cancer and evaluate its clinical significance in the prognosis and survival analysis of gastric cancer patients.materials and methods: a total of 50 tumor tissues and marginal control tissues were obtained from gastric cancer patients. first, the relative gene expression of trip13 was determined using quantitative real-time reverse transcriptase-polymerase chain reaction (qrt-pcr) and quantified using the 2-δδct method. then, bioinformatic approaches were used to evaluate trip13 expression in two different cohorts of patients. a data mining study was also performed to determine the prognostic role of trip13 expression in the overall survival of gastric cancer patients. finally, the correlation between gene expression and copy number of trip13 was obtained using ccle database data analysisresults: the expression of trip13 in gastric tumor samples was increased 5.2-fold relative to adjacent normal tissues. conspicuously, this finding was repeated in bioinformatics analyses and trip13 gene expression showed a significant increase in both cohorts of patients. analysis of trip13 gene expression in 37 gastric cancer cell lines showed that the expression of this gene was significantly correlated with the number of copies. we also found a negative correlation between the high expression of trip13 and overall survival in gastric cancer patients.conclusion: it could be concluded that trip13 may act as a promising biomarker and a potential therapeutic target for gastric cancer diagnosis and treatment.