تعیین میزان آلودگی به سالمونلا، کمپیلوباکتر و فراوانی ژن cdt در نمونه‌های مدفوع کودکان مبتلا به گاستروانتریت

هدف: گاستروانتریت حاد یک اختلال شایع است که 12-8% از مراجعه‌های سرپایی کودکان را شامل می‌شود. عفونت‌های کمپیلوباکتر و سالمونلا حدود 8.4% و 11% از موارد اسهال جهانی را شامل شده که مرتبط با عوارض و بیماری‌های خارج روده‌ای می‌باشند. با توجه به اهمیت این باکتری‌ها در بیماری‌های کودکان، هدف از این مطالعه تعیین میزان عفونت با سالمونلا، گونه‌های کمپیلوباکتر و هم‌چنین بررسی فراوانی ژن کد‌کننده‌ی cytholethal distending toxin در بروز اسهال ناشی از جامعه در کودکان مبتلا در نظر گرفته شد.مواد و روش‌ها: نمونه مدفوع کودکان مبتلا به اسهال از بیمارستان‌های کودکان شهرهای همدان، اردبیل، بندرعباس و بیمارستان‌های علی‌اصغر و کودکان مفید در تهران جمع‌آوری شدند. dna ژنومی از نمونه‌های مدفوع با استفاده از کیت استخراج گردید. حضور جنس و گونه‌های کمپیلوباکتر ژژونی و کولی، ژن cdtb کمپیلوباکتر و جنس سالمونلا از طریق پرایمرهای اختصاصی بررسی شد. هم‌چنین کمینه تشخیص (lod) این باکتری‌ها در نمونه‌های مدفوع به روش pcr تعیین گردید.یافته‌ها: بررسی نتایج آزمایشگاهی میزان lod جهت شناسایی مستقیم را 100 باکتری در هر گرم مدفوع تعیین گردید. بر این مبنا از میان 144 نمونه مدفوع کودکان مبتلا به اسهال حاد، یک مورد از نظر حضور کمپیلوباکتر ژژونی مثبت گردید. این نمونه از نظر حضور ژن cdtb نیز مثبت بود. حضور جنس سالمونلا در دو نمونه از بیماران مثبت گزارش شد (1.4%).  نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه میزان فراوانی کمی از ابتلا به باکتری‌های کمپیلوباکتر و سالمونلا در نمونه‌های تحت بررسی را طی پاندمی کووید19 در کودکان زیر 5 سال نشان داد. بررسی این نمونه‌ها از نظر ابتلا به ویروس‌ها و سایر عوامل میکروبی می‌تواند سبب‌شناسی بروز اسهال در کودکان مراجعه‌کننده به بیمارستان‌ها را روشن‌تر نماید. 

molecular investigation of campylobacter spp. and salmonella infection in children with community acquired diarrhea

introduction: acute gastroenteritis is a typical disorder that accounts for 8-12% of pediatric outpatient visits. campylobacter and salmonella infections account for about 8.4% and 11% of global diarrhea cases. due to the importance of these bacteria in pediatric diseases, the aim of this study was to determine the infectious rate of salmonella and campylobacter species and also the frequency of the gene encoding cytholethal distending toxin in children with community-acquired diarrhea.materials and methods: stool samples of children under 5 years of age with diarrhea were collected. the samples were related to children referred to hospitals in hamadan, ardabil, bandar abbas and two hospitals in tehran. dna was extracted from the samples using a dna extraction kit from stool. the presence of campylobacter in the studied samples was detected by polymerase chain reaction using specific primers. a control stool sample was spiked with 10-fold dilution of c. jejuni suspension for lod (detection limit determination) measurement.results: in this study, pcr results showed a lod of 100 cfu per gram in the spiked feces sample. accordingly, out of 144 fecal samples of children with acute diarrhea, one case was positive for campylobacter jejuni; this sample was also positive for the presence of cdtb gene. presence of salmonella was confirmed in two samples of the patients (1.4%).conclusion: low prevalence of campylobacter and salmonella was detected in symptomatic children under 5 years of age during the covid-19 pandemic. examination of these samples for viruses and other microbial agents can clarify the etiology of diarrhea in children referred to the hospitals.