>
Fa   |   Ar   |   En
   مطالعه‌ی رابطه‌ی ساختمان -فعالیت کمی دوبعدی و داکینگ مولکولی مشتقات4-آنیلینوکینازولین به عنوان مهارکننده‌ی آنزیم تیروزین کیناز رسپتور فاکتور رشد اپیدرمی  
   
نویسنده قاسمی دوگاهه مهتاب ,ابراهیمی نجف آبادی حشمت اله ,یوسف بیک فاطمه ,قاسمی سعید
منبع كومش - 1401 - دوره : 24 - شماره : 3 - صفحه:405 -420
چکیده    هدف: مشتقات مهارکننده‌ی آنزیم تیروزین کیناز رسپتور فاکتور رشد اپیدرمی (egfr tkis) نقش مهمی را در درمان سرطان ایفا می‌کنند. هدف از این مطالعه بررسی رابطه ساختمان-فعالیت دوبعدی (2d-qsar) و داکینگ مشتقات 4-آنیلینوکینازولین به عنوان egfr tkis و دستیابی به یک مدل مناسب جهت پیش بینی فعالیت این ترکیبات می‌باشد.مواد و روش‌ها: 122 ترکیب حاوی ساختار 4-آنیلینوکینازولین جهت بسط مدل‌های رابطه‌ی ساختمان-فعالیت کمی دو بعدی (2d-qsar) با استفاده از روش رگرسیون خطی چندگانه (mlr)، و روش‌های غیر خطی شبکه‌های عصبی مصنوعی (ann) و ماشین‌های بردار پشتیبانی (svm) استفاده شد. مدل‌ها با استفاده از روش‌های اعتبارسنجی داخلی و خارجی معتبرسازی شدند. داکینگ مولکولی بر روی ترکیبات 32، 75 و 98 با بیش‌ترین pic50 با استفاده از نرم‌افزار autodock 4.2 انجام گرفت.یافته‌ها: توصیف‌گرهای انتخاب شده نشان دادند که الکترونگاتیویته اتمی، قابلیت ایجاد پیوند هیدروژنی، میزان لیپوفیلیسیته و شکل و حجم مولکولی از عوامل موثر بر فعالیت این ترکیبات هستند. معیارهای آماری مربوط به تفسیر و اعتبارسنجی مدل‌ها در بازه مناسبی قرار گرفتند. مدل به دست آمده با روش ann با کم‌ترین میانگین خطای مطلق 0.365 برای سری آموزش و آزمون بهترین مدل انتخابی بود. در مطالعات داکینگ مولکولی ترکیب 75 به عنوان قوی‌ترین ترکیب در مهار tk، انرژی اتصال 8.33- کیلوکالری بر مول را نشان داد.نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد که همه مدل‌ها به خوبی می‌توانند فعالیت ترکیبات را پیش‌بینی کنند. هم‌چنین ترکیبات با قدرت مناسب به جایگاه فعال رسپتور متصل شدند. تمامی فرآیندها از اعتبار کافی برخوردار بودند.
کلیدواژه رابطه ساختمان-فعالیت کمی، رسپتورهای erbb، تحلیل رگرسیون، ماشین بردار پشتیبان، شبکه های عصبی
آدرس دانشگاه علوم پزشکی گیلان, دانشکده داروسازی, گروه شیمی دارویی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی گیلان, دانشکده داروسازی, گروه شیمی دارویی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی گیلان, دانشکده داروسازی, گروه فارماکوگنوزی, ایران, دانشگاه علوم پزشکی گیلان, دانشکده داروسازی, گروه شیمی دارویی, ایران
پست الکترونیکی ghasemi_saeed@yahoo.com
 
   2d-qsar and docking studies of 4-anilinoquinazoline derivatives as epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors  
   
Authors ghasemi dogaheh mahtab ,ebrahimi-najafabadi hesmatollah ,yousefbeyk fatemeh ,ghasemi saeed
Abstract    introduction: epidermal growth factor receptor (egfr) tyrosine kinase inhibitor derivatives play an important role in the treatment of cancer. we aim to construct 2d-qsar models using various chemometrics using 4-anilinoquinazoline-containing egfr tkis. in addition, the binding profile of these compounds was evaluated using a docking study.materials and methods: in this study, 122 compounds of seven different structural categories with a 4-anilinoquinazoline scaffold were obtained from the pieces of literature. 2d-qsar models were prepared using the linear method, including multiple linear regression (mlr), alongside non-linear methods, including artificial neural networks (ann) and support vector machines (svm). the validation of suggested 2d-qsar models was performed using internal and external validation techniques. for molecular docking, three compounds, including compounds 32, 75, and 98, which had the highest pic50, were used. molecular docking was performed using autodock 4.2.results: selected descriptors indicated that atomic electronegativity, hydrogen bonding ability, lipophilicity, and molecular shape and volume were the factors affecting the activity of the compounds. statistical criteria, related to interpretation and validation of the models, were in the appropriate range. the model obtained by the ann method, with the lowest mean absolute error of 0.365 for both training and testing sets, was the best. the compound 75 as the most potent compound indicated binding energies of -8.33 kcal/mol.conclusion: finally, it was found that the models could effectively predict the activity of the compounds. it was also discovered that the compounds were properly bound to the active site of the receptor. in addition, validation results showed that all processes were sufficiently valid.
Keywords quantitative structure-activity relationship ,erbb receptors ,regression analysis ,support vector machine ,neural networks
 
 

Copyright 2023
Islamic World Science Citation Center
All Rights Reserved