شناسایی ژن Cdtb در میان باکتری‌های روده‌ای در بیماران مبتلا به گاستروانتریت و سندرم روده تحریک‌پذیر

هدف: (cdts) cytholethal distinding toxinsاز جمله توکسین های باکتریایی است که تاکنون در برخی از باکتری های گرم منفی مانند اشرشیاکولی، گونه های سالمونلا و کمپیلوباکتر شناسایی شده است. این توکسین از سه ژن مجاور هم شامل cdta، cdtb و cdtc تشکیل شده است. زیرواحد cdtbبخش کاتالیک توکسین بوده و موجب تخریبdna سلول میزبان می شود. علی رغم تعیین حضور ژن cdtb در میان باکتری های مختلف، نقش آن ها در بروز بیماری هایی مانند گاستروانتریت حاد و سندرم روده تحریک پذیر، به خوبی مشخص نشده است. جهت روشن شدن این ارتباط، در این مطالعه فراوانی حضور واریانت های ژنیcdtb در باکتری های مختلف بیماران مبتلا به گاستروانتریت و سندرم روده تحریک پذیر در مقایسه با افراد غیر بیمار بررسی شده است.مواد و روش ها: این مطالعه بر روی نمونه مدفوع جمع آوری شده از بیماران مبتلا به گاستروانتریت و ibs و افراد سالم (گروه کنترل) انجام شد. تمامی نمونه ها تحت استخراج dna ژنومی قرار داده شدند. حضور ژن cdtb باکتری های کمپیلوباکتر،یرسینیا انترکولیتیکا، پروویدنسیا آلکالیفاسینز، سالمونلا انتریکا و اشرشیاکولی به روش pcr با استفاده از پرایمرهای اختصاصی بررسی گردید. در نهایت محصول های ژنی جهت تایید تعیین توالی شدند.یافته ها: کمپیلوباکترهای کد کننده ژن cdtb به ترتیب در 7.5 (5.80) و 34.6 (52.150) درصد افراد مبتلا به سندرم روده تحریک پذیر و گاستروانتریت شناسایی شد. هم چنین 14 درصد (14.100) بیماران با گاستروانتریت و 5 درصد (8.80) مبتلایان به سندرم روده تحریک پذیر حامل سالمونلاهای کدکننده cdtb بودند. هیچیک از نمونه های هر سه گروه مورد مطالعه ژن cdtb اشریشیاکولی و پروویدنسیا آلکالیفاسینز را نداشتند. بررسی توالی های ژنی حاصل هویت ژن های هدف در گونه های باکتریایی مختلف را تایید نمود.نتیجه گیری: نتایج این مطالعه حاکی از حضور باکتری های پاتوژن کدکننده cdtb در دستگاه گوارش بیماران مبتلا به ibs و گاستروانتریت بود. با توجه به حضور بالای سالمونلا و کمپیلوباکتر کد کننده یcdtb در مبتلایان به سندرم روده تحریک پذیر، به نظر می رسد که ابتلا به این باکتری ها یکی از فاکتورهای خطر ابتلا به سندرم روده تحریک پذیرپسا عفونت در بیماران ایرانی باشد.

Detection of cdtB gene among enteric bacteria in patients with gastroenteritis and irritable bowel syndrome

Introduction: Cytolethal distending toxin (CDT) is one of the bacterial toxins that present in a variety of Gramnegative human pathogens, such as E. coli, Salmonella spp. and Campylobacter spp. CDT consist of three subunits encoded by three adjacent genes, including cdtA, cdtB and cdtC. It is approved thet cdtB had toxic activity and caused DNA damage of the host cell. Despite its presence in different bacterial species, role of CDT in acute and chronic infections, such as gastroenteritis and irritable bowel syndrome (IBS) is unclear. To clear this correlation, we studied the prevalence of cdtB gene among different enteropathogenic bacteria in patients with gastroenteritis and IBS compared with healthy people.Materials and Methods: This study was conducted on stool samples that obtained from patients with gastroenteritis, IBS and healthy people (as control). All the samples were subjected to DNA extraction. cdtB of Campylobacter spp., Yersinia entercolitica, Providencia alkalifacience, Salmonella enterica and E. coli was analyzed by PCR using specific primers.Results: CdtB encoding Campylobacter spp. was found in 7.5% (5/80) and 34.6% (52/150) of patients with IBS and gastroenteritis, respectively. Also, the PCR results showed that 14% (14/150) of the patients with gastroenteritis and 5% (8/80) of IBS patients carried CdtB encoding Salmonellaenterica. None of the samples were infected with CdtB encoding E. coli and Providensia spp. Finally, all results were confirmed by sequencing.Conclusion: Our results showed the presence of CdtB encoding pathogenic bacteria in IBS patients and those with gastroenteritis. Regarding the high frequency of CdtB encoding Salmonella and Campylobacterspp., it was proposed that infection to these bacterias could be considered as a risk factor for the development of postinfectious IBS in Iranian patients. Further studies are needed to establish this relationship.