مقایسه روش PCR با روش استاندارد MPN جهت تشخیص آلودگی باکتریایی در آب شرب

زمینه: تشخیص آلودگی میکروبی آب شرب به‌روش کشت علاوه بر هزینه بری، زمان‌بر بوده و بر حسب میزان آلودگی چند روز به‌طول می‌انجامد. این درحالی است که شهروندان در این زمان از آب مورد بررسی استفاده می‌نمایند. روش‌های ملکولی دارای حساسیت و سرعت عمل بالایی و زمان عملیاتی کمتری هستند. در این تحقیق روش multiplex pcr جهت ارزیابی سریع میکروبی آب از نظر کلی فرم، ecoli و تشخیص احتمالی باکتری‌های vbnc در آزمایشگاه باکتریولوژی شرکت آب و فاضلاب استان مرکزی و مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان در فاز عملیاتی اجرا گردید.مواد و روش‌ها: تشخیص سریع کلی فرم با کمک آمپلی فیکاسیون ژن‌های lacz و uida در واکنش multiplex pcr طراحی و اجرا گردید. 80 نمونه آب شرب شهر اراک شامل 41 نمونه چاه، 36 نمونه شبکه و 3 نمونه مخزن در این بررسی جمع‌آوری شده و با استفاده از آمپلی‌فیکاسیون ژن‌های lacz و uida مورد آزمایش multiplex pcr قرار گرفتند. همچنین آزمایش mpn به‌عنوان روشی استاندارد و جهت مقایسه یافته‌ها، روی تمامی نمونه‌ها انجام شد. روش‌های multiplex pcr و mpnروی باکتری استاندارد، باکتری‌های خالص شده از نمونه‌های mpn مثبت و نیز crm(certificated reference material، (سویه مرجع) انجام گردیدند. یافته‌ها: در نمونه‌های چاه، شبکه و مخزن، اکثر نمونه‌ها در هر دو روش نتایج مشابه را نشان دادند. نتیجه pcr روی باکتری استاندارد، کشت‌های خالص شده نمونه‌های mpn مثبت و crm نیز تایید کننده روش pcr بود. پنج نمونه دارای pcr مثبت و نتیجه mpn منفی گزارش شدند. زمان کل عملیات pcr با تغییر فاکتورها به حدود یکصد و پنج دقیقه کاهش یافت.نتیجه‌گیری: روش multiplex pcr، امکان شناسایی همزمان باکتری‌های کلی فرم کل و اشرشیاکلی را در آب آشامیدنی فراهم نمود.