ارزیابی حفاظت در ترادف ژن carD و استفاده از آن در تشخیص سریع مایکوباکتریوم توبرکلوزیس

زمینه: سرعت رشد سلولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس وابسته به رونویسی rrna است که در مایکوباکتریوم توسط ژن card کنترل می-شود. هدف این تحقیق، ارزیابی حفاظت در ترادف ژن card و استفاده از آن در تشخیص سریع سویه‌های کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی متفاوت است.مواد و روش‌ها: ژنوم تخلیص شده 38 سویه بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با الگوی مقاومت دارویی مختلف انتخاب شدند. پرایمرهای مورد نظر، با تعیین ژن‌های بالادست و پایین دست جهت تکثیر کامل ژن card طراحی و با نرم‌افزارهای مربوطه ارزیابی شدند. با محاسبه دمای ذوب، دمای اتصال و برنامه pcr تنظیم شد. وجود ژن تکثیر شده با کمک الکتروفورز تایید گردید. ژن، خالص سازی شده و مورد سکانس (توالی یابی) قرار گرفت. یافته‌ها: بررسی نتایج تعیین توالی نشان داد که ژن card در نمونه های مختلف کلینیکی و سویه استاندارد، یکسان بوده و الگوی مشابه‌ای دارد. در این تحقیق مشخص گردید که دامین trcf درمنطقه n ترمینال پروتیین card در سویه های مورد مطالعه کاملاً حفاظت شده است. نتیجه گیری: این تحقیق، اولین مطالعه روی ژن card در سویه های بالینی می باشد. نتیجه سکانس، تعیین کننده وجود حفاظت در این ژن بود. با توجه به اهمیت این ژن در زندگی باکتری و عدم تغییر در توالی آن، در مطالعات آینده این ژن به عنوان هدفی مناسب برای تشخیص سریع و نیز طراحی یک مهار کننده ضد میکوباکتریوم پیشنهاد می‌گردد.