جداسازی و بررسی توالی ژن هماگلوتینین ویروس انفلوانزای A/H1N1 عامل پاندمی 2009 (جدایه‌ی ایران)

زمینه: ویروس انفلوانزا پاتوژن تنفسی مهمی است که سالانه منجر به درصد بالایی از بیماری و مرگ ومیر می‌شود. ویروس جدید a/h1n1 (novel) که در سال 2009 جمعیت زیادی از مردم جهان را درگیر کرد، از بازآرایی ژنوم سه نوع ویروس انفلوانزای انسانی، خوکی و پرندگان به‌وجود آمده است. با توجه به نقش مهم هماگلوتینین (ha) در عفونت‌زایی ویروس انفلوانزا، تعیین توالی ژنوم این پروتیین و بررسی تغییرات آن ضروری به‌نظر می‌رسد. در این مطالعه ژن ha ویروس a/h1n1 novel جدایه‌ی ایران جداسازی و بررسی گردید.مواد و روش‌ها: در این مطالعه آزمایشگاهی، ژنوم ویروس از نمونه‌های مستقیم بیمار مبتلا به انفلوانزای novel ah1n1 که با روش real-timepcr و بر پایه پروتکل بین‌المللی در آزمایشگاه تحقیقات انفلوانزای انستیتو پاستور به تایید رسیده بودند، استخراج شد و طول کامل ژنوم ha با استفاده از پرایمرهای اختصاصی به‌روش one step-rt-pcr تکثیر یافت. ژنوم تکثیر یافته بعد از کلونینگ در ناقل pgem-t easy، با آنالیز آنزیمی و تعیین توالی تایید گردید.یافته‌ها: طول کامل ژن بیان کننده پروتیین ha به کمک pcr از نمونه‌های بیمار جدا شد و پس از الکتروفورز و مشاهده قطعه مورد انتظار 1777 جفت بازی، استخراج از ژل صورت گرفته و سپس در ناقل pgem-t easy کلون و تعیین ترادف شد. توالی حاصله با استفاده از نرم‌افزار chromas ویرایش 45/1 مورد بررسی قرار گرفت و نهایتاً با کد دستیابی 1/419001 hqدر بانک ژنی ثبت گردید.نتیجه‌گیری: نتایج آنالیز نوکلیوتیدی نشان داد که توالی فوق با تمام سکانس‌های گزارش شده از سراسر دنیا از جمله سویه توصیه شده برای واکسن مطابقت دارد.