|
|
آنالیز دادههای متابونومیکس بهدست آمده از طیفسنجی تشدید مغناطیس هسته 1H NMR جهت ارایه مسیرهای متابولیکی بیماری آرتریت روماتویید
|
|
|
|
|
نویسنده
|
ارجمند محمد ,گلشاهی آتوسا ,موحد علی ,امینی اعظم ,اکبری زیبا
|
منبع
|
طب جنوب - 1393 - دوره : 17 - شماره : 2 - صفحه:141 -149
|
چکیده
|
زمینه: آرتریت روماتویید از بیماریهای اکتسابی بافت همبند میباشد و دارای زیر گروههای گوناگونی است که دربیشتر اوقات علت اصلی آن را نمیتوان مشخص نمود. هدف از این مطالعه، کاربرد اسپکتروسکوپی 1hnmr جهت بررسی نمای متابولیکی و کسب اطلاعات بیوشیمیایی خون انسان سالم و مقایسه متابولوم آنها با سرم خون بیمار آرتریت روماتوییدی فعال میباشد. متابونومیکس بر پایه nmr، برای آنالیز سریع نمونههای بیولوژیکی مناسب بوده و روش اسپکتروسکوپی 1hnmr، نسبت بهروشهای دیگر آنالیز، ارجحیت دارد. آنالیز بیماری بهکمک تشدید مغناطیس هسته به تشخیص زود هنگام بیماری نیز منجر میگردد. بدیهی است، این تشخیص زود هنگام میتواند، تاثیر زیادی در کیفیت زندگی و روند بهبود این دسته از بیماران بنماید. در این مطالعه هدف ما بررسی پروفایل متابولیکی سرمی بیماران آرتریت روماتویید بهمنظور شناسایی بیومارکر جدید و الگوی متابولیکی در این بیماران میباشد. مواد و روشها: به منظور بررسی متابولومیکس بیماران آرتریت روماتویید از سرم خون 16 بیمار که در فاز فعال بیماری آرتریت روماتویید بودند و 16 فرد سالم که از نظر جنس و سن مشابه گروه بیمار بودند استفاده شد. در تمام نمونهها، حضور فاکتور روماتوییدی آرتریت از طریق افزایش در مقدار t1 مایع سینوویال مفصلی نشان داده شده است. در این مطالعه به کمک روشهای pca و plsda و همچنین نرمافزارهای کنومکس و کد محاسباتی پرومتب در محیط متلب تمامی متابولیتهای موجود در این بیماری را طبقهبندی شد و یافتهها با بانک دادههای متابولیتی hnmr (www.metabolomics.ca) مقایسه شد. همچنین آزمونهای، ana (anti nucleair antibody) و anti ccp (anti cyclic citrullinated peptide) و اوره نیز بهکمک روش الایزا و رنگسنجی مورد ارزیابی قرار گرفت.یافتهها: در این بررسی، مسیرهای متابولیکی که بیشترین تغییرات را داشتهاند عبارتند از مسیر بیوسنتز هورمونهای استروییدی، متابولیسم بیوتین، بیوسنتز اسیدهای چرب، مسیر بیوسنتز اسیدهای آمینه والین، لوسین و ایزولوسین و همچنین متابولیسم اسیدهای چرب لینولییک شناسایی شدند.نتیجهگیری: در بیماری روماتیسم و بیماریهای مزمن التهابی، فعال شدن دستگاه دفاعی باعث مصرف بیش ازحد انرژی میگردد، atp بهترین منبع انرژی درون سلولی است و از مسیرهای گلیکولیزوفسفوریلاسیون اکسیداتیو بهدست میآیند. تغییرات مشاهده شده در مسیر سنتز و ورود به سیکل کربس اسیدهای آمینه والین و لوسین و همچنین سنتز اسیدهای چرب آزاد نیز تایید کننده نیاز بالای انرژی میباشد. در این افراد، افزایش سنتز و کاتابولیسم اسیدهای چرب منجر به تولید استیلکوا و سنتز اجسام کتونی میگردد. با توجه به اینکه بیماری روماتیسم زیر گروههای مختلفی داشته، و نیاز به روشهای دقیقتری جهت تشخیص میباشد، بنابراین پیشنهاد میگردد با استفاده از الگوی بهدست آمده از این مطالعه میتوان به پیدایش بیومارکرهای جدید در تشخیص زود هنگام بیماری روماتیسم کمک نمود.
|
کلیدواژه
|
متابونومیکس ,اسپکتروسکوپی NMR ,PLSDA ,PCA ,Pattern recognition ,آرتریت روماتویید. ,Metabonomics ,rheumatoid arthritis ,NMR spectroscopy ,metabolic finger print
|
آدرس
|
انستیتو پاستور ایران, ایران, انستیتو پاستور ایران, ایران, دانشگاه علوم پزشکی بوشهر, مرکز تحقیقات پزشکی هستهای، پژوهشکده علوم زیست پزشکی خلیج فارس، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر, ایران, دانشگاه علوم پزشکی بوشهر, گروه روماتولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی بوشهر, ایران, انستیتو پاستور ایران, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|