تیپ‌بندی ملکولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس‌های جدا شده از بیماران ایرانی با استفاده از توالی‌های تکراری چند شکل غنی از gc

زمینه: توبرکلوزیس (tb) با بیش از 10 میلیون مورد جدید در سال و به عنوان یکی از 10 عامل مرگ ومیر مطرح در دنیا، همچنان یکی از مهم‌ترین مشکلات بهداشت جهانی است. همچنین سل مقاوم به درمان چند دارویی (mdr)، خطر جدی برای سلامت عمومی است. درک الگوی اپیدمیولوژیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس (mtb)، که موجب برآاورد انتقال اخیر و عود عفونت tb می‌باشد، با روش‌های تیپ‌بندی ملکولی امکان‌پذیر می‌باشد. این مطالعه با هدف مسیریابی و تعیین نوع انتقال عفونت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس همراه با عوامل دموگرافیکی با روش pgrs_rflp انجام شد.مواد و روش‌ها: در این مطالعه 90 نمونه جمع‌آوری شده از بیماران مبتلا به سل ریوی از استان‌های شمال غرب و غرب ایران، با تشخیص فراوانی توالی‌های غنی از gc تیپ‌بندی گردید و عوامل دموگرافیکی مرتبط با انواع انتقال بیماری بررسی شد. یافته‌ها: تمام جدایه‌های تحت مطالعه به44 خوشه تقسیم شدند، که 28 تیپ آن (33.3 درصد) منحصر به فرد بوده و 16 تیپ در خوشه‌های چند عضوی قرار گرفتند. و بزرگ‌ترین خوشه، خوشه 8 عضوی (9.52 درصد)، مربوط به استان‌های غرب ایران بود. نتیجه‌گیری: تنوع ژنتیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس دراین منطقه بسیار بالاست. میزان انتقال اخیر بر اساس خوشه‌بندی دور از انتظار بود (متوسط جهانی 4030 درصد). انتقال اخیر بیماری در منطقه غرب ایران در مقایسه با منطقه شمال غرب بسیار پویاتر بود. خوشه‌بندی بر اساس pgrs_rflp، همبستگی بالای اطلاعات ملکولی و کلاسیک را نشان می‌دهد. همچنین وجود رابطه معنی‌دار بین سابقه واکسیناسیون و خوشه‌بندی لزوم انجام مطالعات گسترده را نشان می‌دهد.

Molecular Typing of Mycobacterium Tuberculosis Isolated from Iranian Patients Using Highly Abundant Polymorphic GC-Rich-Repetitive Sequence

Background: Tuberculosis (TB) with more than 10 million new cases per year and one of the top 10 causes of death worldwide, is still one of the most important global health problems. Also, multi drugresistant tuberculosis (MDR) is a serious danger to public health. Understanding of the epidemiological pattern of mycobacterium tuberculosis (MTB), Estimates of recent transmission and recurrence of infection, it ispossible with molecular typing methods. The present study was performed aiming to track and determine the type of Mycobacterium tuberculosis infection, as well as its relationship with demographic factors, using PGRSRFLP.Materials and Methods: In this study, 90 samples collected from TB patients from the North West provinces of Iran, Molecular typing by Characterization highly abundant polymorphic GCrichrepetitive sequence. Investigated Demographic factors associated with the transmission of the disease.Results: All isolates were grouped into 44 clusters 28types (33.3%) of the subspecies were in unique stains and 66.7% (from 56 patients) had clustered isolates. The largest cluster contained 8 isolates (9.52%) was the West provinces of Iran.Conclusion: Genetic variation of Mycobacterium tuberculosis is high in this region. The rate of recent transmission based on clustering was unexpected (The global average is 30%40%). The recent transmission was more dynamic in the west than northwest Iran. Clustering based on PGRSRFLP can demonstrate the high correlation between molecular and classic information. In addition, the significant relationship between vaccination record and clustering highlights the necessity to conduct more extensive studies.