به روز رسانی ژنوتیپ‌های شایع ویروس هپاتیت c در اهداکنندگان خون ایران

سابقه و هدف عفونت با ویروس هپاتیتc (hcv)، یکی از عوامل اصلی بیماری مزمن کبدی در سراسر جهان است.hcv یک ویروس انتقال یابنده از طریق خون و در نتیجه تهدیدی جدی برای سلامت عمومی است. تعیین ژنوتیپ‌های hcv نقش مهمی را در بررسی راه‌های انتقال عفونت ایفا می‌نماید. این پژوهش با هدف بررسی وجود تغییر در الگوی ژنوتیپ‌هایhcv در اهداکنندگان ایرانی انجام پذیرفت. مواد و روش‌هادر این مطالعه مقطعی از آذر ماه سال 1394 تا خرداد ماه 1396، 239 اهداکننده از سراسر کشور که دارای نتیجه مثبت در آزمایش تاییدی ویروسhcv بودند، مورد بررسی قرارگرفتند. از روش semi nested pcr جهت تکثیر قسمتی از ناحیه ns5b ژنوم ویروس استفاده شد. محصول pcr، توالی‌یابی و ژنوتیپ hcvبا استفاده از نرم‌افزار(blast) basic local alignment search tool تعیین شد. با استفاده از رسم درخت فیلوژنتیک، ژنوتیپ‌ها تایید شدند. برای تجزیه و تحلیل داده‌ها از نرم‌افزار آماری 13 stata استفاده شد.یافته‌هااز 239 شرکت‌کننده، در 106 فرد(6.3%±44.35%) ژنوتیپ تعیین و تایید شد. در درخت فیلوژنتیک، تمامی توالی‌های مورد مطالعه، 3 کلاستر جداگانه تشکیل دادند. سه ژنوتیپ 3a ، 1a و 1b به ترتیب ژنوتیپ‌های رایج در اهداکنندگان ایران بودند. نتیجه گیریبه نظر می‌رسد طی دهه گذشته، اپیدمیولوژی مولکولی عفونت hcv در اهداکنندگان ایران از نظر تنوع ژنوتیپ تغییری نداشته است ولی تغییر در فراوانی ژنوتیپ‌ها و در نتیجه جابه‌جایی ژنوتیپ شایع 1a توسط ژنوتیپ 3a رخ داده است.

Update on HCV genotypes among Iranian blood donors

AbstractBackground and ObjectivesHepatitis C (HCV) infection is one of the main causes of chronic hepatitis diseases all over the world. HCV is a transfusion transmitted virus and a serious threat to general health. HCV genotyping has an important role in tracing routes of infection. This study aimed at investigating the changes in distribution pattern of HCV genotypes among Iranian blood donors. Materials and MethodsIn this cross sectional study, 239 HCV confirmed blood donors from Jun. 2015 to Nov. 2017 were included. Semi nested PCR method was used for amplifying the NS5B region of HCV genome. PCR products were sequenced and HCVgenotypes were determined by searching the sequences in Basic Local Alignment Search Tool (BLAST). Phylogenetic tree was constructed to confirm HCV genotypes. STATA 13 software was used for data analysis. ResultsIn 106 (44.35%±6.3%) out of 239 participants, HCV genotype was determined and confirmed. In phylogenetic tree, studied sequences formed three separated clusters. Genotype 3a, 1a and 1b were the common genotypes. Conclusions It seems that molecular epidemiology of HCV infection did not change based on variability of genotypes but changes in the frequency of genotypes have been occurred as a result of replacement of genotype 1a by genotype 3a during the last decade among Iranian blood donors.