احتمال نقش تنظیمی mir-146a بر ژن‌های دخیل در مسیرهای داخل سلولی سرطان معده القا شده توسط هلیکوباکتر پیلوری بر اساس یافته‌های بیوانفورماتیکی

سابقه و هدف سرطان معده چهارمین سرطان شایع دنیا و دومین عامل مرگ و میر محسوب می شود. عوامل محیطی و هم چنین عوامل ژنتیکی، نقش به سزایی در ابتلا و پیشرفت این بیماری ایفا می کنند. مهم ترین این عوامل هلیکوباکتر پیلوری است که در اکثر بافت های سرطانی قابل رویت است. با ورود میکرو rna ها به حوزه یافته های ژنتیکی، این مولکول های قدرتمند جایگاه خود را در حوزه ژنتیک بیماری ها باز کردند. mirnaها، مولکول های کوچک غیرکدکننده ای هستند که در پروسه های متعدد سلولی از قبیل تمایز و مرگ سلولی شرکت دارند. در این مطالعه، با استفاده از پایگاه داده های بیوانفورماتیک ژن های دخیل در مسیرهای سیگنالینگ سلولی موثر در فرآیند سرطانی شدن سلول ها و ارتباط آن با mir-146a بررسی شده است.مواد و روش ها این مطالعه از نوع تئوریکال بیوانفورماتیکی بوده و به صورت نظری با مراجعه به پایگاه داده target scan ، mir-tar base و 2.0 mir walk انجام پذیرفت. پس از به دست آوردن پروتئین هایی که تحت تاثیر mir146a قرار می گیرند، بررسی نهایی در پایگاه david به منظور دست یابی به مسیرهای سیگنالینگ انجام گرفت که به تفصیل به شرح آن پرداخته می شود.یافته ها بر اساس نتایج به دست آمده، mir-146a احتمالاً می تواند با تاثیر بر پروتئین هایی از قبیل p53 ، bcl2 ، اعضای خانواده rasو پروتئین های دخیل در مسیر jak-stat ، mirna کلیدی در جلوگیری از پیشرفت بیماری باشد. نتیجه گیری با توجه به این نتایج می توان گفت mir-146a احتمالاً می تواند از طریق افزایش متاستاز و حمله بافتی و هم چنین کاهش چسبندگی بین سلولی و مهار مرگ سلولی، به عنوان مارکر تاییدی تشخیصی و پیش آگهی دهنده پیشرفت سرطان مورد استفاده قرار گیرد.

In silico studies revealed a crucial role for miR-146a on progression of Helicobacter pylori induced gastric cancer

AbstractBackground and ObjectivesStomach cancer is currently ranked as the fourth most common cancer and the second regarding to the mortality rate. Environmental and genetic factors both play crucial role in the onset of inflammation in the stomach and progression of the cancer. In a majority of gastric cancer cases, Helicobacter Pylori infection is a responsible factor. Nowadays, the micro RNAs are pinpointed as the powerful molecules in the field of disease genetics. In the present study by implementing several bioinformatics database, we have undertaken a research on the association of miR146a with the expression of the genes involved in cell signaling pathways in gastric cancer development.Materials and MethodsThis type of study was theoretical bioinformatics. The first step to candidate the most important miRNAs is to collect data from the previous studies; then, miRWalk 2.0 and miRTarBase databases were chosen for primary studies. The final review was made at David database in order to achieve pathways involved in gastric cancer.ResultsBased on the results from this study, miR146a was predicated as a key factor in preventing the cancer progression by affecting an increase on metastasis and tissue attack and preventing apoptotic pathways.ConclusionsData revealed that the expression of miR146a increased the progress of gastric cancer. Thus, the analysis of the miR146a expression could be accounted as a valuable marker for prognosis of gastric cancer.Key words: Stomach Neoplasms, MicroRNAs, Helicobacter