|
|
بررسی بیان ژن zbtb16 با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک و روشهای ایمونوسیتوشیمی و ایمونوهیستوشیمی در سلولهای بنیادی شبه جنینی برگرفته شده از سلولهای بنیادی اسپرماتوگونیال بیضه موش: یک مطالعه آزمایشگاهی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
مسعودی مهلا ,عزیزی حسین ,غلامی داریوش ,خاکی امیر
|
منبع
|
مجله دانشگاه علوم پزشكي رفسنجان - 1402 - دوره : 22 - شماره : 9 - صفحه:947 -962
|
چکیده
|
زمینه و هدف: سلولهای بنیادی اسپرماتوگونیال (spermatogonia stem cells; sscs) میتوانند سلولهای بنیادی شبه جنینی (eembryonic stem-like; es-like) را تولید کنند که هر دو دارای پتانسیل سلولهای بنیادی پرتوان میباشند. ژن zbtb16 (zinc finger and btb domain containing 16) عملکردهای مختلفی در مسیر سیگنالینگ، تنظیم تمایز و رشد سلولی دارد. هدف از پژوهش حاضر شناسایی مسیرهای سیگنالینگ مرتبط با ژن zbtb16 با روشهای بیوانفورماتیک و بررسی میزان بیان این ژن در sscs و es-like میباشد.مواد و روشها: در این مطالعه آزمایشگاهی، ابتدا 100 ژن دارای ارتباط و اتصال با zbtb16 از پایگاه پروتئینی استخراج و توسط نرمافزارهای مرتبط آنالیز شدند. در ادامه، سلولهای es-like از sscs بیضه موش استخراج و کشت داده شدند. سپس با انجام رنگآمیزی ایمونوسیتوشیمی و ایمونوهیستوشیمی بیان zbtb16 در سلولهای es-like و sscs بررسی شد.یافتهها: نتایج نشان داد که بیان zbtb16 در جمعیت تمایز نیافته sscs و es-like به وضوح دیده میشود. همچنین، بیان شد که در صورت حذف zbtb16 از شبکه ژنی میتوان در برخی از مسیرهای سیگنالینگ نامطلوب اختلال ایجاد کرد، زیرا zbtb16 بهعنوان یک فاکتور رونویسی خاص در غنی کردن مسیرهای خاصی دخالت دارد.نتیجهگیری: یافتههای تجربی میتوانند از آنالیز رشد سلولهای اسپرماتوگونیال در in vivo و in vitro حمایت کنند و روشهای بیوانفورماتیک با شناسایی عملکردهای بیولوژیکی که zbtb16 در تنظیم آنها دخیل میباشد، نشان دادند که برای ضعیف کردن برخی مسیرهای نامطلوب میتوان از zbtb16 به عنوان ژن هدف استفاده نمود.
|
کلیدواژه
|
سلولهای بنیادی اسپرماتوگونیال، سلولهای بنیادی شبه جنینی، مسیر سیگنالینگ، ارتباط پروتئین-پروتئین، zbtb16
|
آدرس
|
دانشگاه فناوری های نوین آمل, دانشکده زیست فناوری, گروه زیست فناوری, ایران, دانشگاه فناوری های نوین آمل, دانشکده زیست فناوری, گروه زیست فناوری, ایران, دانشگاه تخصصی فناوری های نوین آمل, دانشکده زیست فناوری, گروه زیست فناوری, ایران, دانشگاه تخصصی فناوری های نوین آمل, دانشکده دامپزشکی, گروه دامپزشکی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
a.khaki@ausmt.ac.ir
|
|
|
|
|
|
|
|
|
investigation of zbtb16 gene expression by bioinformatics analysis and immunocytochemistry and immunohistochemistry methods in embryonic cells derived from spermatogonial stem cells of mouse testis: a laboratory study
|
|
|
Authors
|
masoudi mahla ,azizi hossein ,gholami dariush ,khaki amir
|
Abstract
|
background and objectives: spermatogonial stem cells (sscs) can generate embryonic stem-like (es-like) cells, both of which possess the potential for pluripotent stem cells. the gene zbtb16 (zinc finger and btb domain containing 16) plays various roles in signaling pathways, cellular differentiation regulation, and growth. the aim of this research was to identify signaling pathways associated with the zbtb16 gene using bioinformatics methods and investigate the expression levels of this gene in sscs and es-like cells.materials and methods: in this experimental study, initially, 100 genes with connections to zbtb16 were extracted from the protein database and analyzed using relevant software. subsequently, es-like cells were extracted from mouse testicular sscs and cultured. then, the expression of zbtb16 in es-like cells and sscs was examined through immunocytochemistry and immunohistochemistry staining.results: the results indicated that the expression of zbtb16 was demonstrated in the undifferentiated population of sscs and es-like cells. it was found that deleting zbtb16 from the gene network could disrupt undesirable signaling pathways since zbtb16 is involved in enriching specific pathways as a specific transcription factor.conclusion: the experimental findings can support the analysis of spermatogonial cell growth in both in vivo and in vitro. bioinformatics methods, by identifying biological functions that zbtb16 regulates, have shown that zbtb16 can be used as a target gene to weaken certain undesirable pathways.
|
Keywords
|
spermatogonial stem cells ,embryonic stem-like cells ,signaling pathways ,protein-protein interaction ,zbtb16
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|