بررسی بیوانفورماتیکی تاثیر ترکیبات گیاهی موجود در گیاهان دارویی Ferulago Angulat، Scrophularia Striata و Laurus Nobilis در مهار پروتئین‌های موثر در بروز مقاومت آنتی‌بیوتیکی در استافیلوکوکوس اورئوس: یک مطالعه توصیفی

زمینه و هدف: اخیراً عفونت های ناشی از استافیلوکوکوس اورئوس (staphylococcus aureus; s. aureus) و ایجاد جدایه های مقاوم به آنتی بیوتیک ها افزایش یافته است. بنابراین مطالعات فراوانی به منظور معرفی ترکیبات جدید با فعالیت ضد s. aureus به ویژه ترکیباتی با منشاء طبیعی جهت مقابله با گونه های مقاوم به آنتی بیوتیک انجام گرفته است. هدف از این مطالعه تعیین غربال گری بیوانفورماتیکی مهارکننده های نوین پروتئین های مرتبط با بروز مقاومت آنتی بیوتیکی موجود در گیاهان دارویی بود. مواد و روش ها: در این مطالعه توصیفی، ابتدا ساختار سه بعدی ترکیبات فیتوشیمیایی موجود در سه گیاه دارویی ferulago angulat، scrophularia striata و laurus nobilis از پایگاه داده pubchem دریافت شد. سپس ساختار سه بعدی چهار پروتئین مرتبط با بروز مقاومت آنتی بیوتیکی شامل β-lactamase، پروتئین متصل شونده به پنی سیلین a2 (a2pbp)، ونکومایسین a (vana) و d-آلانیل d-آلانین دی پپتیداز (vanx) به کمک پایگاه داده های پروتئین به دست آمد. در نهایت، توانایی ترکیبات شیمیایی انتخاب شده جهت مهار پروتئین های مرتبط با مقاومت آنتی بیوتیکی مذکور با استفاده از روش داکینگ مولکولی به وسیله نرم افزار 1. 2igemdock بررسی شد. یافته ها: نتایج نشان داد که اکثر ترکیبات مورد بررسی، برهمکنش های مناسبی با تمامی پروتئین های مورد مطالعه به ویژهvanx دارند. نتایج هم چنین نشان داد که دو ترکیب phthalate (ethylhexyl2)bis و palmitic acid قوی ترین برهمکنش ها را با تمامی پروتئین های مورد بررسی دارند. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که که دو ترکیب phthalate (ethylhexyl2)bis و palmitic acid موجود در گیاهان دارویی بررسی شده کاندیدهای مناسبی برای مطالعات برون تنی و درون تنی مرتبط با فعالیت ضد s .aureus مقاوم به آنتی بیوتیک می باشند.

Bioinformatics Study of the Effects of Some Phytocompounds Found in Ferulago Angulat, Scrophularia Striata and Laurus Nobilis Medicinal Plants on Inhibition of the Proteins Causing Antibiotic Resistance in Staphylococcus Aureus: A Descriptive Study

Background and Objectives: Currently infections caused by Staphylococcus aureus have increased and raised antibiotic resistant isolates. Therefore, lots of studies have been done to introduce novel antiS.aureus compounds especially natural originated constitutes. Hence, this study aimed to determine bioinformatics screening of novel inhibitors of antibiotic resistanceassociated proteins in S.aureus from medicinal plants.Material and Methods: Firstly, in this descriptive study, threedimension structure of a set of phytochemicals from three medicinal plants including Ferulago angulat, Scrophularia striata, Laurus nobilis were retrieved from PubChem database. Then, threedimension structure of four antibiotic resistanceassociated proteins including beta;lactamase, penicillin binding protein 2A (PBP2a), Vancomycin A (VanA) and DalanylDalanine dipeptidase (VanX) were obtained from Protein Data Bank. Finally, the ability of the selected phytocompounds for inhibition of the mentioned antibiotic resistanceassociated proteins was investigated using molecular docking method by iGemdock 2.1 software.Results: The results showed that most of the tested compounds had appropriate interaction to all the studied proteins especially to VanX. The results also revealed that Bis (2ethylhexyl) phthalate and Palmitic acid had strongest interactions to all the tested proteins.Conclusion: The results of this study showed that Bis (2ethylhexyl) phthalate and Palmitic acid found in the surveyed medicinal plants are good candidates for more in vitro and in vivo studies about antibacterial activity against antibiotic resistant S. aureus.Keywords: Staphylococcus aureus, Antibiotic resistance, Medicinal plants, Bioinformatics.Funding: None declared.Conflict of interest: None declared.Ethical approval: None declared. How to cite this article: Shakeran Z, Shakeran Z, Nosrati M. Bioinformatics Study of the Effects of Some Phytocompounds Found in Ferulago Angulat, Scrophularia Striata and Laurus Nobilis Medicinal Plants on Inhibition of the Proteins Causing Antibiotic Resistance in Staphylococcus Aureus: A Descriptive Study. J Rafsanjan Univ Med Sci 2019; 18 (2): 17792. [Farsi]