طراحی، ساخت، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنی

زمینه و هدف: شیگلا شایع ترین عامل اسهال می باشد. آنتی ژن پلاسمیدی ipad برای تهاجم باکتری به درون سلول میزبان ضروری می باشد. یکی از چالش ها در باره واکسن مخاطی علیه شیگلا بر پایه پروتیین ipad قدرت پایین آن می باشد. به نظر می رسد که با متصل کردن ipad به یک ناقل و ادجوانت مناسب همچون زیر واحد b سم ریسین، می توان پروتیین ipad را بسیار ایمنوژنیک نمود. این مطالعه به منظور تولید وکتور بیانی نوترکیب دارای کاست ژنی rtb-ipad، آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی آن انجام گرفته است.روش بررسی: در این مطالعه ژن های rtb و (163-483) ipad در وکتور pgem-t همسانه سازی شدند. ژن ipad به روش برش آنزیمی با ژن rtb به همراه لینکر کد کننده gpgp در وکتور pgem متصل شد. سپس قطعه کایمریک rtb-ipad در وکتور بیانی pet28a(+) زیر همسانه سازی گردید. در پایان آنالیز تعیین توالی و بررسی بیوانفورماتیکی کاست ژنی انجام گرفت.یافته ها: صحت ساخت کاست ژنی rtb-ipad در وکتور بیانی pet28a(+) با واکنش pcr و هضم آنزیمی مورد تایید قرار گرفت. نتایج حاصل از تعیین توالی کاست ژنی مطابق با توالی ذخیره شده در بانک ژنی بود. مطالعات بیوانفورماتیکی بر مبنای شاخص سازگاری کدون نشان داد این کاست قابلیت بیان در گیاه ترانس ژن و برخی سویه های باکتری اشرشیاکلی را دارد.نتیجه گیری: اتصال rtb به عنوان ناقل و ادجوانت به آنتی ژن ipad رویکردی نوین و مطلوب در جهت تولید واکسن مخاطی شیگلوزیس می باشد.