بررسی بیوانفورماتیکی به‌منظور یافتن میکروRNA مهار کننده مسیر PI3K/AKT و ارزیابی در رده‌های سلولی سرطان پروستات

هدف: سرطان پروستات دومین سرطان شایع و پنجمین عامل مرگ ناشی از سرطان مردان در سال 2012 در جهان است. مسیر pi3k/akt نقش اساسی در بیماری‏زایی سرطان پروستات دارد و به­دلیل نقش کلیدی این مسیر در پیشروی سرطان آن را به هدف جذابی برای استراتژی‌های جدید درمانی تبدیل می‌کند. یکی از روند‌های تنظیمی ژن‌ها، میکرو‌rnaها است که توانایی ویژه‌ای برای کنترل چندین ژن و مسیر به‌طور هم‌زمان، آن‌ها را کاندید قابل توجهی برای اهداف درمانی می‌کند. این مطالعه با هدف به دست آوردن میکروrna موثر بر مسیر pi3k/akt با روش‌های بیوانفورماتیکی و بررسی نتایج حاصل در سلول‌های رده پروستات انجام شد.مواد و روش‌ها: برای پیدا‌ کردن میکروrna موثر بر مسیر pi3k/akt، شش ژن این مسیر که به‌عنوان هدف‌های دارویی مطرح هستند را در ده الگوریتم متفاوت پیش‌بینی بررسی شد. سپس به‌صورت بیوانفورماتیکی میکروrna حاصل از نظر میزان بیان در بافت پروستات سالم و رده‌های سلولی سرطان پروستات و همچنین از لحاظ هدف‌گیری در نرم‌افزارهای تجزیه و تحلیل چرخه ارزیابی شد. به‌صورت عملی بیان میکروrna‌های کاندید در نمونه کنترل و رده‌های سلولی سرطان پروستات ارزیابی شد.نتایج: خانواده mir 29 بیشترین شناسایی را از مجموعه 6 ژنی داشتند و سایر بررسی‌های بیوانفورماتیک نیز موید نتیجه حاصل بودند. بررسی‌ها نشان دهنده کاهش بیان معنی‌دار خانواده mir 29 در رده‌های سلولی سرطان پروستات lncap، pc3 و du 145 نسبت به نمونه کنترل سالم است.نتیجه‌گیری: ﻧﺘﺎﻳﺞ ﻣﺒﺘﻨﻲ ﺑﺮ ﺗﺠﺰﻳﻪ و ﺗﺤﻠﻴﻞﻫﺎی ﺑﻴﻮاﻧﻔﻮرﻣﺎﺗﻴﻚ و ﺑﺮرﺳﻲ ﺑﻴﺎن خانواده mir 29، نشان دهنده امکان استفاده از خانواده mir 29 برای مهار مسیر pi3k/akt در سرطان پروستات است.