رونمایی یک پروتیین ایمنی‏زای اختصاصی در اسینتوباکتر بومانی

هدف: اسینتوباکتر بومانی یک باکتری گرم منفی، غیر متحرک و هوازی اجباری است که به عنوان بیماری زای بیمارستانی شناخته شده و غالباً مقاوم به انواع آنتی‏بیوتیک‏هاست. این باکتری همچنین به عنوان یک عامل مهم شیوع و مرگ و میر در بیمارستان‏ها مخصوصاً در میان بیماران دارای نقص ایمنی شناسایی شده است. کنترل و درمان عفونت ناشی از آن به دلیل توانایی بیماری زا برای مقاومت به انواع آنتی‏بیوتیک‏ها و زنده ماندن در شرایط محیطی مختلف و استفاده از طیف وسیعی از منابع غذایی، سخت است. تشخیص اولیه عفونت ایجاد شده به وسیله اسینتوباکتر بومانی استراتژی مهمی برای کنترل کردن عفونت بیمارستانی ناشی از این باکتری بیماری زا است. روش‏های رایج شناسایی این باکتری به وسیله روش‏های کشت معمول و آزمون‏‏های بیوشیمیایی است که به‏دست آوردن نتایج آن‏ها بین ? تا ? روز طول می‏کشد. بنابراین یک آزمون جدید، سریع، حساس، اختصاصی و اقتصادی که مدیریت سریع عفونت‏های اسینتوباکتر بومانی را فراهم می‏کند، مورد نیاز است. ایجاد یک آزمون تشخیصی اختصاصی و حساس به نشانگر زیستی نیاز دارد که واکنش تقاطعی با باکتری‏های دیگر نداشته و تنها برای اسینتوباکتر بومانی اختصاصی باشد.مواد و روش‏ها: بر این اساس، هدف از این مطالعه شناسایی و توالی‏یابی یک پروتیین غشای خارجی 4/34 کیلودالتون معرفی شده توسط اسلام و همکارانش از بین پروتیین‏های غشای خارجی اسینتوباکتر بومانی atcc 19606 است. در مطالعه حاضر از نرم‏افزارهای مختلف بیوانفورماتیکی برای غربالگری کل پروتیوم باکتری استفاده شد. غربالگری پروتیین‏ها با توجه به ویژگی‏هایی از جمله وزن مولکولی، موقعیت‏یابی، توپولوژی، همولوژی، آنتی‏ژنی و آلرژی‏زایی صورت گرفته است.نتایج: سه پروتیین در وزن مولکولی بین 33-36 کیلودالتون به عنوان پروتیین غشای خارجی شناسایی شدند. براساس تجزیه و تحلیل های انجام شده و پیش‏بینی‏های آنتی‏ژنی و دیگر بررسی‏های صورت گرفته تنها یکی از ? پروتیین به عنوان آنتی‏ژن اختصاصی اسینتوباکتر بومانی شناخته شد.نتیجه‏گیری: بهترین نامزد پروتیینی با شماره دستیابی zp_05827218.1 توسط بررسی‏های بیوانفورماتیکی تعیین شد.