مقایسه روش‌‎های متداول و روش مولکولی در تشخیص گونه‌های کاندیدای جداشده از نمونه‌های اوروفارنژیال کاندیدیازیس

اهداف: گونه‌های کاندیدا فلور نرمال بدن انسان و عامل بیشترین عفونت‌های بیمارستانی در افراد دارای زمینه هستند. با توجه به اهمیت تشخیص صحیح آنها، مطالعه حاضر با هدف مقایسه روش‌های رایج با روش مولکولی در تشخیص گونه‌های مختلف کاندیدا به‌منظور یافتن روش بهینه انجام شد.مواد و روش‌ها: 60 ایزوله کاندیدای جداشده از بیماران مبتلا به اوروفارنژیال کاندیدیازیس با استفاده از روش‌های رایج شامل تولید جرم تیوب، کشت روی محیط کروم آگار، استفاده از کیت api 20 c aux و روش مولکولی its sequencing شناسایی شدند. میزان توافق (ضریب k) بین روش‌های رایج در مقایسه با روش مولکولی با استفاده از نرم‌افزار spss 16.0 محاسبه شد.یافته‌ها: از 60 ایزوله کاندیدای مورد مطالعه، 10 ایزوله (16/6%) در تست جرم تیوب، 8 ایزوله (13/33%) در تست api و 9 ایزوله (15%) در تست کشت روی محیط کروم آگار دارای تشخیص متفاوت در مقایسه با روش مولکولی its sequencing بودند. روش جرم تیوب بیشترین (0/90 =k) و کشت روی کروم آگار کمترین (0/66 =k) توافق را در مقایسه با روش مولکولی در شناسایی گونه کاندیدا آلبیکنس نشان داد.نتیجه‌گیری: نتایج نشان داد که روش‌های معمولی به‌تنهایی قادر به تشخیص همه گونه‌های کاندیدا نیستند و روش‌های مولکولی مانند its sequencing، می‌توانند برای تشخیص قطعی به کار برده شوند.

Comparison of Conventional and Molecular Methods in Identification of Candida Species Isolated from Oropharyngeal Candidiasis

Aims: Candida species are normal flora in the human body and are the main cause of hospital infections in people with underlying disease. The purpose of the present study was comparison of the conventional and molecular laboratory methods in identifying different species of Candida to find the optimal method.Materials Methods: 60 Candida isolates were obtained from oropharyngeal candidiasis patients and recognized using laboratory routine methods including germ tube production, culture on CHROMagar medium, API 20 C AUX kit and molecular ITS sequencing method. The concordances between the methods compared to the molecular method were measured by the kappa coefficient using SPSS 16.0 software.Findings: Out of 60 Candida isolates, 10 isolates (16.6%) in germ tube formation test, 8 isolates (13.33%) in the API test, and 9 isolates (15%) in the culture on CHROMagar medium have different results in comparison to the ITS sequencing method. Germ tube (k= 0.90) and culture on CHROMagar medium methods (k= 0.66) showed the highest and the lowest agreement with the molecular method in the identification of Candida albicans species respectively.Conclusion: The results showed that conventional methods alone cannot diagnose all Candida species and molecular methods such as ITS sequencing can be used to confirm the identification.