شناسایی و تشخیص مولکولی سروتیپ های استرپتوکوکوس پنومونیه جدا شده از بیمارستان های منتخب تهران با روش multiplex pcr

سابقه و هدف: استرپتوکوکوس پنومونیه جزء پاتوژن های مهم ایجاد کننده بیماری های تهاجمی مثل پنومونی و مننژیت می باشد. مطالعات اپیدمیولوژیک سروتیپ های این میکروارگانیسم جهت ارزیابی تاثیر واکسن پنوموک در هر جامعه لازم می باشد. لذا این مطالعه به منظور شناسایی و تشخیص مولکولی سروتیپ های استرپتوکوکوس پنومونیه با روش multiplex pcr جدا شده از بیمارستان های منتخب تهران انجام شد.مواد و روش ها: این مطالعه مقطعی بر روی 32 ایزوله استرپتوکوکوس پنومونیه بدست آمده از نمونه های بالینی بیماران بستری شده در بیمارستان های مختلف تهران، انجام شد. ایزوله ها بر اساس تست های فنوتیپی و روش pcr شناسایی شدند. از روش multiplex pcr جهت تعیین سروتیپ استفاده شد.یافته ها: تعداد و درصد ایزوله های استرپتوکوکوس پنومونیه جدا شده از نمونه های مایع مغزی نخاعی، خلط، خون، مایع شستشو برونش، چشم و ترشحات بینی به ترتیب 12 (37/6%)، 7 (21/8%) ، 6 (18/7%) ، 3 (9/5%)، 2 (6/2%) و 2 ایزوله (6/2%) بود. در مطالعه حاضر سروتیپ های شناسایی شده به سروتیپ های 1، 4، a/b6 ، f7، v9، a11، 14، a15، a19، f19و f23 تعلق داشتند.نتیجه گیری: بر اساس نتایج به دست آمده، بیش از پنچاه درصد سروتیپ ها جزء سروتیپ های موجود در واکسن های رایج مورد استفاده در جامعه نبودند.

Molecular Identification and Detection of Streptococcus Pneumoniae Serotypes Isolated from Selected Hospitals in Tehran Using Multiplex PCR Method

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Streptococcus pneumoniae is one of the major pathogens responsible for invasive diseases such as pneumonia and meningitis. Epidemiological studies of these microorganisms are necessary to evaluate the effect of pneumococcal vaccine in any community. Therefore, the present study was conducted for molecular identification and detection of Streptococcus pneumoniae serotypes isolated from selected hospitals in Tehran using multiplex PCR method.METHODS: This crosssectional study was performed on 32 isolates of Streptococcus pneumoniae from clinical specimens of patients admitted to different hospitals in Tehran. The isolates were identified by phenotypic tests and PCR method. Multiplex PCR was used to determine the serotype.FINDINGS: The number and percentage of Streptococcus pneumoniae isolates isolated from cerebrospinal fluid, sputum, blood, bronchoalveolar lavage, eyes, and nasal discharge were 12 (37.6%), 7 (21.8%), 6 (18.7%), 3 (9.5%), 2 (6.2%), and 2 (6.2%) isolates, respectively. In the present study, the identified serotypes were the serotypes 1, 4, 6A/B, 7F, 9V, 11A, 14, 15A, 19A, 19F, and 23F. CONCLUSION: Based on the results of this study, more than 50% of the serotypes were not among the serotypes present in the vaccines that are commonly used in the community.