شناسایی سریع ایزوله های انتروکوکوس فکالیس با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز(pcr)

سابقه و هدف: انتروکوکوس فکالیس به عنوان یک پاتوژن مهم در عفونت های بیمارستانی مطرح می باشد. شناسایی سریع انتروکوکوس فکالیس در عفونت های خطرناک به خصوص در افراد با نقص ایمنی مسئله مهمی به شمار می رود. هدف از انجام این مطالعه بررسی کارایی ژن ef0737 در شناسایی ایزوله های انتروکوکوس فکالیس و گونه های مشابه شامل انتروکوکوس فیسیوم و استافیلوکوکوس اورئوس می باشد.مواد و روش ها: در این مطالعه مقطعی 150 ایزوله بالینی شامل 50 ایزوله انتروکوکوس فکالیس‌‌‌، 50 ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و 50 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس از منابع مختلف عفونت جمع آوری شد. طراحی پرایمر با استفاده از توالی ژن ef0737 انجام شد و همه ایزوله ها از نظر حضور ژنef0737 با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) مورد بررسی قرار گرفتند. حساسیت pcr بر اساس ایزوله های بالینی انتروکوکوس فکالیس و اختصاصیت پرایمرها بر اساس ایزوله های غیر انتروکوکوس فکالیس شامل 50 ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و 50 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس بررسی شد.یافته ها: در این مطالعه از مجموع 150 ایزوله بالینی ( 50 ایزوله انتروکوکوس فکالیس، 50 ایزوله انتروکوکوس فیسیوم و 50 ایزوله استافیلوکوکوس اورئوس ) همه ایزوله های انتروکوکوس فکالیس از نظر حضور ژن ef0737 مثبت و حساسیت تست 100% محاسبه شد. همچنین ایزوله های انتروکوکوس فیسیوم و استافیلوکوکوس اورئوس همگی از نظر حضور ژن ef0737 منفی شدند که نشانگر اختصاصیت پرایمرها بود.نتیجه گیری: pcr بر اساس نتایج این مطالعه یک روش حساس و کاربردی در شناسایی سریع انتروکوکوس فکالیس به خصوص در بیماران با شرایط بحرانی می باشد. شناسایی ژن حفاظت شده ef0737 در نمونه های بالینی احتمالا منجر به تشخیص سریع عفونت ناشی از انتروکوکوس فکالیس می شود.

Rapid Identification of Enterococcus Faecalis Isolates by Polymerase Chain Reaction

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Rapid detection of Enterococcus faecalis as a frequent cause of nosocomial infections in immunocompromised patients is an important issue. Herein, the current study developed a PCR assay based on the ef0737 gene to detect E. faecalis isolates.METHODS: In this crosssectional study, 150 clinical isolates including E. faecalis, E. faecium and Staphylococcus aureus were collected. A set of pair primers was designed using the sequence of ef0737. All isolates were examined for the presence of ef0737 gene by PCR assay. The sensitivity of PCR assay was evaluated according to 50 clinical isolates of E. faecalis. The specificity of PCR primers was also determined using nonE. faecalis species including 50 E. faecium and 50 S. aureus isolates.FINDINGS: In this study, from 150 clinical isolates that were collected; all the 50 E. faecalis isolates showed positive results for the ef0737 gene which showed 100% sensitivity. No amplification were observed in other isolates include E. faecium and S. aureus.CONCLUSION: PCR assay is a more efficient and sensitive tool for detection and characterization of E. faecalis especially in patients with the critical condition. Identification of the preserved ef0737 gene in clinical samples may be able to determine infections caused by E. faecalis.