تحلیل ژنتیکی بررسی بیان و مسیرهای سیگنالینگ و انالیز شبکه‌های برهمکنش برخی ژن‌های دارای بیان متفاوت حاصل از نتایج چند مطالعه مایکروارای در بیماران مبتلا به اوتیسم با کمک نرم‌افزار R

زمینه و هدف: اوتیسم شامل مجموعه‌ای از اختلالات محیطی و ژنتیکی در سیستم عصبی است که حاصل آن نقص در رفتارها و نحوه ارتباطات اجتماعی، رفتارهای کلیشه‌ای و مشکل در توانایی‌های حرکتی و ناتوانی در برنامه‌ریزی‌های حرکتی می‌باشد. این عوامل شدت این بیماری و نحوه پاسخ آن به درمان را تحت تاثیر قرار می‌دهند. مواد و روش‌ها: این مطالعه در صدد شناسایی فهرست مشترکی از ژن‌های متفاوت بیان‌شده (deg) با استفاده از یکی از روش‌های متاآنالیز توسط ابزارهای بیوانفورماتیک بود که سه مطالعه مایکروارای شناسایی شدند که 109 نمونه را شامل می‌شدند که 90 نفر آنها بیمار و 19فرد دیگر سالم بودند. تجزیه‌وتحلیل‌های این مطالعات با نرم‌افزار انجام شد و متاآنالیز بر روی آنها انجام گرفت.یافته‌ها: پس از جداسازی ژن‌های دارای بیان متفاوت، با کمک آنالیزهای آماری توسط نرم‌افزار r ژن‌های (eif1ay, eif2s3,il32, arpc4-ttll3,lilra5 ,eif5a ,xist, rara, txlng,) به‌دست آمدند. سپس با بررسی آنتولوژی آنها از طریق دیتابیس enrichr و ارتباط مسیرهای برهمکنشی آنها از طریق pathways و شبکه‌های برهمکنشی با دیگر ژن‌های موثر در بیماری اوتیسم، نتاج نهایی به‌دست آمد.نتیجه‌گیری: با شناسایی ژن‌های دارای بیان متفاوت در مطالعات مختلف که دچار کاهش یا افزایش بیان معنادار شده بودند و بررسی آنها در مسیرهای بیولوژیکی و مولکولی و سلولی مشخص شد این مجموعه از ژن‌ها می‌توانند در اوتیسم و برخی مسیرهای موثر در فرایند عملکردی این بیماری نقش داشته باشند پس می‌توان با بررسی اهداف تاثیرگذاری و محصولات آنها راهکارهای درمانی مطلوبی را در زمینه مهار آنها ارائه کرد.

genetic meta-analysis of expression and signaling pathways and analysis of interaction networks of some genes with different expression from the results of several microwave studies in patients with autism using r software

introduction: autism is a set of environmental and genetic disorders in the nervous system that result in defects in social behaviors, social communication, stereotyped behaviors and difficulty in motor skills and inability to plan motor. these factors are the severity of the disease and how affect its response to treatment.materials and methods: in this study, we sought to identify a common list of different genes expressed (deg) using a meta-analysis method by bioinformatics tools. three microwave studies were identified, including 109 samples, of which 90 were sick and 19 were healthy. these studies were analyzed by software and meta-analysis was performed on them.results: after isolation of genes with different expression with the help of statistical analysis by r software, genes (eif1ay, eif2s3, il32, arpc4-ttll3, lilra5, eif5a, xist, rara, txlng,) were obtained and then by examining their gene ontology from the final results were obtained through the enrichr database and the association of their interaction pathways with pathways and interaction networks with other genes involved in autism.conclusion: by identifying genes with different expression in different studies that had a significant decrease or increase in expression and examining them in biological, molecular and cellular pathways in general, it was found that this set of genes can be used in autism and some pathways in the functional process. this disease has a role, so it is possible to provide desirable treatment strategies to control them by examining the targets of their effects and products.