شناسایی ژن‌های سیکلوتید در گونه‌های بنفشه و بررسی آثار ضدمیکروبی سیکلوتیدهای استخراج‌ شده

اهداف: سیکلوتیدها خانواده بزرگی از پپتیدهای گیاهی با فعالیت زیستی و ویژگی‌های ساختاری متمایز است که در خانواده‌های گیاهی روبیاسه‌ها، کوکوربیتاسه‌ها و ویولاسه‌ها بیان می‌شود. سیکلوتیدها به‌دلیل فعالیت‌های زیستی متعدد از جمله ضدویروس، ضدباکتری و ضدسرطان، همچنین ساختار منحصربه‌فردی که پایداری حرارتی و آنزیمی بی‌نظیری به آن‌ بخشیده است، انتخابی مناسبی برای مهندسی پروتئین در کاربردهای دارویی و کشاورزی است.مواد و روش‌ها: در این پژوهش، استخراج ژن‌های کدکننده سیکلوتیدها از چهار نمونه گیاه بنفشه v. odorata، v. occulta، v. ignobilis، v. spathulata انجام شد. به‌منظور شناسایی ژنسیکلوتید، طراحی پرایمر و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز صورت گرفت. همچنین، آثار ضدمیکروبی مجموعه سیکلوتیدها بررسی شد. برای رسیدن به این هدف از روش جزءگیری و استخراج با فاز جامد استفاده شد.یافته‌ها: حضور ژن‌های سیکلوتید در گونه‌های مورد مطالعه به اثبات رسید. بررسی آثار ضدمیکروبی سیکلوتیدها نشان داد که از میان باکتری‌های بیماری‌زای انسانی استافیلوکوکس اورئوس بیشترین حساسیت را به پپتیدهای مورد مطالعه دارد و در بین مجموعه باکتری‌ها بیشترین حساسیت مربوط به سویه زانتوموناس اوریزوآ است، چرا که نقش ذاتی سیکلوتیدها در گیاه میزبان دفاع در مقابل آفات است. نتیجه‌گیری:  به ‌طور کلی، به‌نظر می‌رسد که احتمالاً می‌توان از پپتید سیکلوتید حاصل از این‌ گونه‌های بنفشه به‌دلیل وجود اثر ضدمیکروبی در مصارف دارویی استفاده کرد. همچنین، مطالعه توالی سیکلوتیدها نشان می‌دهد، علی‌رغم وجود اسید آمینه‌های حفاظت‌شده در اکثر سیکلوتیدها، تفاوت عملکرد در آن‌ها به‌دلیل تنوع توالی است.