|
|
گزارشها و میزبانهای جدید گونههای curvularia در ایران
|
|
|
|
|
نویسنده
|
جانبزرگی سحر ,مهرابی کوشکی مهدی ,فرخی نژاد رضا
|
منبع
|
رستنيها - 1398 - دوره : 20 - شماره : 1 - صفحه:1 -13
|
چکیده
|
در مطالعه حاضر، هشت جدایه از جنس curvularia، جداسازی شده از گیاهان لوبیا چشمبلبلی، ذرت و شیشهشور در استان خوزستان، براساس روش مبتنی بر فیلوژنی مولکولی و ریختشناسی شناسایی شدند. زیستتوده میسلیومی جدایهها، تولید شده در محیط مایع سیب زمینیدکستروز، به وسیله کاغذ صافی جمعآوری و خشکانجمادی شد. توده dna با استفاده از یک روش مبتنی بر فنل و کلروفرم استخراج شد. بخشهایی از نواحی rdna هستهای و gpd با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر و سپس توالییابی شدند. توالیهای its و gpd مربوط به جدایههای تحت تحقیق با توالیهای معتبر مربوط به سویههای تیپ در بانک ژن با استفاده از الگوریتم blastn و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی (مبتنی بر دو ناحیه ژنومی) مورد مقایسه قرار گرفتند. بر این اساس، جدایهها در سطح گونه شناسایی و گونههایc. americana، c. muehlenbeckiae و c.verruculosa را شامل شدند. لذا، این نخستین گزارش دو گونه c. americana و c. muehlenbeckiae در ایران میباشد. به علاوه، این مطالعه برای هر سه گونه مورد بررسی میزبان جدیدی گزارش میکند و مشخصات ریختشناسی و مولکولی بیشتری برای گونه c.verruculosa ارایه میدهد.
|
کلیدواژه
|
ریخت شناسی، فیلوژنی مولکولی، ذرت، شیشه شور، لوبیا چشم بلبلی
|
آدرس
|
دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه گیاهپزشکی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی، مرکز تحقیقات بیوتکنولوژی و علوم زیستی, گروه گیاهپزشکی, ایران, دانشگاه شهید چمران اهواز, دانشکده کشاورزی, گروه گیاهپزشکی, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
New records and hosts of the Curvularia species in Iran
|
|
|
Authors
|
Janbozorgi Sahar ,Mehrabi-Koushki Mehdi ,Farokhinejad Reza
|
Abstract
|
In present study, eight isolates of the genus Curvularia, recovered from plants of the cowpea, maize and bottlebrush in Khuzestan province, were identified based on molecular phylogeny in combination with morphology. The mycelial biomass of the isolates, produced in potatodextroseBroth, were collected by passing through filter papers and freezedried. DNA was extracted using a phenol and chloroformbased method. The partial regions of nrDNA and gpd were amplified using the appropriate primers and then sequenced. The consensus ITS and gpd sequences of the isolates under survey were compared to reference sequences of the type strains in GenBank by BLASTn algorithm and twoloci phylogenetic analysis. Accordingly, the isolates were identified at species level as follow: Curvularia americana, C. muehlenbeckiae,and C.verruculosa. To our knowledge, this is the first record of both the C. americana and C. muehlenbeckiae in Iran. Moreover, this study reports new hosts for all three species with further morphological and molecular characterization of C.verruculosa species as well.
|
Keywords
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|