تعیین توالی در چند ناحیه ژنی(MLST):یک روش تایپینگ مولکولی باقدرت تمایز بسیار بالا جهت شناسایی گونه های کاندیدا آلبیکنس در مطالعات اپیدمیولوژیکی
|
|
|
|
|
نویسنده
|
افسریان سید محمدحسین ,بدلی حمید ,شکوهی طاهره
|
منبع
|
مجله دانشگاه علوم پزشكي مازندران - 1392 - دوره : 23 - شماره : 106 - صفحه:161 -174
|
چکیده
|
گونه های کاندیدا مخمرهایی هستند که در همه جا یافت می شوند و به راحتی از محیط جدا می شوند. آن ها جز پاتوژن های فرصتطلب انسان ها هستند. کاندیدیازی سدر بیماران با ضعف سیستم ایمنی، نیازمند تشخیص و اقدام درمانی سریع م یباشد. کاندیدا آلبیکن سبیشترین گونه جدا شده از این بیماران است. جهت پیشگیری از عفونت های بیمارستانی ناشی از کاندیدا آلبیکن س، تشخیص مولکولیآن ها برای درک بهتر اپیدمیولوژی این عفونت ها و اتخاذ استراتژی های پیشگیری مناسب ، ضروری است . در یکی دو دهه اخیر ،روش های تایپینگ مولکولی مختلفی برای کاندیدا آلبیکنس شرح داده شده است. یکی از این روش ها، تعیین توالی در چند ناحیه ژنیروشی mlst . است که برای مطالعات اپیدمیولوژیکی و جمعیتی، بسیار کاربرد دارد (multilocus sequence typing یا mlst)با قدرت تمایز بسیار بالا متکی بر آنالیز پلی مورفیسم های نوکلیوتیدی در توالی های 7 ناحیه ژنی برای کاندیدا آلبیکنس است. توالی هاییا st) به دست آمده از هر ناحیه ژنی به عنوان یک آلل و آلل های به د ست آمده در هر ناحیه ، در مجموع ، یک سکانس تیپقابل دسترس می باشد که با استفاده از نتایج www.mlst.net نامیده می شود. در این زمینه، پایگاه داده ها در سایت (sequence typeتایپینگ گونه ها در این پایگاه، آنالیز داده ها انجام می گیرد. آنالیز تعداد زیادی کاندیدا آلبیکن ساز میزبان های مختلف و مواضع بالینیباعث افزایش بینش محققان در اپیدمیولوژی عفونت های کاندیدایی کسب شده از بیمارستان به علاوه ساختار ،mlst متفاوت با روشجمعیتی کاندیدا آلبیکن سمی شود و الگوهای انتقال و تکامل کاندیدا آلبیکن سآشکار می گردد و به ارزیابی تنوع ژنتیکی و پویا شناسیجمعیت کاندیدا آلبیکنس، کمک می کند.
|
کلیدواژه
|
تنوع ژنتیکی ,کاندیدا آلبیکنس ,تایپینگ مولکولی ,تعیین توالی در چند ناحیه ژنی(MLST)
|
آدرس
|
دانشگاه علوم پزشکی مازندران, دانشجوی دکتری، کمیته تحقیقات دانشجویی، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری, ایران, دانشگاه علوم پزشکی مازندران, استادیار، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی ساری و مرکز تحقیقات قارچ های تهاجمی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران, ایران, دانشگاه علوم پزشکی مازندران, استاد، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی، دانشکده پزشکی ساری و مرکز تحقیقات قارچ های تهاجمی، دانشگاه علوم پزشکی مازندران، ساری، ایران, ایران
|
پست الکترونیکی
|
shokohi.tahereh@gmail.com
|
|
|
|
|