بررسی موتاسیون در ژن gyraدر سویه های بالینی اشریشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه جدا شده ازبیمارستان امام خمینی(ره) شهرستان ساری

سابقه و هدف: افزایش تعداد مقاومت به کوئینولون‌ها در باکتری‌های اشرشیا کلی و کلبسیلا پنومونیه‌های جدا شده از ساری، مشکلات فراوانی را در درمان ایجاد نموده است. موتاسیون در ژن gyra منجر به تغییر اسیدهای آمینه و مقاومت به فلئوروکینولون‌ها در باکتری‌های اشرشیاکلی و کلبسیلا پنومونیه می‌باشد. هدف ما از این مطالعه، تشخیص جهش‌های قابل توجه از ایزوله‌های جدا شده به روش sscp pcr می باشد.مواد و روش‌ها: ایزوله‌های جدا شده جمع‌آوری و تست حساسیت آنتی‌بیوتیکی )سیپروفلوکساسین، نالیدیکسیک اسید) معمول به روش دیسک دیفیوژن آگار انجام شد. مقاومت فلوروکینولون با استفاده از آزمون mic به روش etest تایید شد. از روش sscp pcr برای تشخیص جهش در ژن ser83asp87) gyra( استفاده شد. نتایج به دست آمده از روش sscp pcr برای تایید به‌طور راندوم، تعیین توالی گردید.یافته‌ها: از 103 ایزوله جدا شده، 65 نمونه (63.2 درصد) اشرشیاکلی و 38 نمونه (36.8 درصد) کلبسیلا پنومونیه بودند. ایزوله‌های جدا شده با روش sscp pcr بررسی شدند. در همه‌ی نمونه‌های اشرشیاکلی مقاوم به سیپروفلوکساسین، حداقل یک موتاسیون مشاهده گردید. هم‌چنین در همه نمونه‌های کلبسیلای مقاوم به سیپروفلوکساسین، حداقل یک موتاسیون و در 14 نمونه در هر 2 نقطه موتاسیون مشاهده گردید، در حالی که در 5 نمونه حساس به سیپروفلوکساسین هیچ موتاسیونی دیده نشد.استنتاج: نتایج نشان داد که جهش در gyra ارتباط نزدیکی با مقاومت کینولون‌ها دارد. افزایش شیوع مقاومت کینولون ها در میان باکتری e.coli و k.penumune جدا شده، نشان دهنده نیاز به برنامه‌های کنترل عفونت می باشد.

Evaluating the gyrA Gene Mutation in Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae Isolates in Sari Imam Khomeini Hospital, Iran

Background and purpose: Increasing resistance to Quinolones in Escherichia coli and Klebsiella pneumonia in Sari, has caused many problems in treatment. Mutation in gyrA gene lead to changes in amino acids and resistance against Fluoroquinolones in E. coli and K. pneumonia. This study aimed at identifying remarkable mutations in E. coli and K. pneumonia isolates using PCRSSCP analysis.Materials and methods: Antibiotic sensitivity test (ciprofloxacin, nalidixic acid) was performed using Agar Disk Diffusion method. Resistance to fluoroquinolones was confirmed by Etest. (MIC experiment). We used PCRSSCP method to detect mutation in gyrA (ser83 - asp 87) genes. Then, the PCR products were randomly sequenced.Results: From 103 isolates, 65 (63.2 %) were E. coli and 38 (36.8%) were K. pneumoniae. In all E.coli isolates resistant to Ciprofloxacin, at least one mutation was observed. Also, in all K. pneumoniae samples resistant to Ciprofloxacin, at least one mutation was seen and in 14 samples two mutation points were observed, but in 5 samples that were sensitive to Ciprofloxacin no mutation was observed.Conclusion: This study showed that the mutation in gyrA genes is closely related to quinolones resistance. High prevalence of quinolones resistance in E. coli and K. pneumoniae isolates requires more appropriate infection control programs.