آنالیز منحنی ذوب dna با کیفیت بالا (hrm) به منظور شناسایی استافیلوکوک اورئوس و سویه مقاوم به متی سیلین

سابقه و هدف: آنالیز منحنی ذوب dna با کیفیت بالا (hrm) یکی از حساس ترین و دقیق ترین روش ها جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس و مقاومت به متی سیلین است. این مطالعه با هدف آنالیز منحنی ذوب dna با کیفیت بالا، به منظور شناسایی سویه های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین انجام پذیرفت.مواد و روش ها: در این مطالعه تجربی، از سویه های استاندارد استافیلوکوک اورئوس atcc25923 و atcc 33592 استفاده شد. جهت شناسایی استافیلوکوک اورئوس از ژن its، و مقاومت به متی سیلین از ژن meca استفاده گردید. با استفاده از نرم افزارهای stepone software v2.3 و hrm software v3.0.1 تجزیه و تحلیل انجام شد و نتایج تعیین توالی به عنوان گلد استاندارد مورد استفاده قرار گرفت.یافته ها: حساسیت آنالیتیکی روش pcr با استفاده از پرایمر its قادر به شناسایی cfu 10^4 باکتری بوده و برای ژن meca تا cfu 10^3 باکتری را تشخیص داد. حسایت آنالیتیکی روش hrm نیز برای پرایمر ژن its تا رقت cfu 2^-10 و پرایمر ژن meca تا رقت cfu 5^-10 قدرت شناسایی باکتری را داشته است. در تجزیه و تحلیل نتایج hrm نیز کم ترین مقدار خطا در منحنی ها ذوب dna مشاهده گردید به طوری که، با در نظر گرفتن نزدیک ترین بازه دمایی به منظور تجزیه و تحلیل، دمای ذوب برای ژن its مقدار 0.5 ± 86 درجه سلسیوس و برای ژن meca مقدار 0.5±81 درجه سلسیوس به دست آمد. نتایج دما و تعیین توالی اختصاصیت بالای روش hrm را نشان داد.استنتاج: روش hrm از نظر تشخیص مقدار کم باکتری، دارای حساسیت و اختصاصیت بالایی می باشد.