تشخیص استرپتوکوکوس پنومونیه بر اساس ژن‌های cpsb ، cpsd و psaa

سابقه و هدف: تشخیص سریع عفونت های پنوموککی به منظور درمان موفق و پیشگیری از عواقب آن بسیار مهم است. لذا، هدف ز این مطالعه راه اندازی روش pcr براساس ژن های رمزکننده کپسول استرپتوکوکوس پنومونیه بوده است.مواد و روش ها: در این مطالعه تجربی، براساس سکانس رفرانس ژن های cpsb، cpsd، aroe و psaa استرپتوکوکوس پنومونیه پرایمرهای اختصاصی طراحی گردید. هر باکتری به طور جداگانه مورد استخراج ژن قرار گرفت. پروتکل pcr طراحی و انجام شد. محصول pcr سکانس و نتایج به صورت توصیفی تحلیل گردید.یافته ها: نتایج نشان داد، پرایمرهای طراحی شده علیه ژن های cpsb، cpsd، aroe و psaa قادر به تکثیر قطعات 159، 202، 254 و 286 جفت بازی هستند. مقایسه و همسان سازی قطعات تکثیر شده با ژن های رفرانس همولوژی 100 درصدی را نشان داد.استنتاج: نتایج حاکی از آن بود که می توان با استفاده از ژن های ویرولانس سویه های استرپتوکوکوس پنومونیه بیماری زا را از سویه های غیر بیماری زا و نیز سویه های ویریدانس تشخیص داد. بنابراین، با استفاده از روش ارایه شده در این تحقیق احتمالاً بتوان سویه های بیماری زای استرپتوکوکوس پنومونیه را تشخیص داد و گزارش نمود.

Diagnosis of Streptococcus Pneumoniae based on cpsB, cpsD, and psaA Genes

Background and purpose: Fast diagnosis of pneumococcal infections is of great importance in achieving successful outcomes. The aim of this study was to use PCR process based on capsular encoding genes of Streptococcus pneumonia.Materials and methods: In this experimental study, specific primers were designed based on the reference sequences of the Streptococcus pneumoniae cpsB, cpsD, aroE, and psaA genes. All bacteria were subjected to DNA extraction separately. Then, the PCR protocol was performed. Sequencing of the PCR products was done and data was analyzed descriptively.Results: The primer pairs against the cpsB, cpsD, aroE, and psaA genes amplified 159, 202, 254, and 286 bp fragments, respectively. The alignments and comparison of amplified sequences showed a high homology (100%) with the reference genes.Conclusion: According to this study, it is possible to diagnose Streptococcus pneumoniae based on virulence genes, and differentiate the pathogenic Streptococcus pneumoniae from nonpathogenic strains and also viridans groups. Therefore, this method is suggested in diagnosis of pathogenic Streptococcus pneumoniae strains.