فرا-آزمون qtl درگستره ژنوم به منظور شناسایی نواحی ژنومی پایدار مرتبط با ویژگی‌های کمی در جمعیت‌های مختلف هلو

به منظور شناسایی مناطق ژنومی پایدارتر و موثر در کنترل ویژگی‌های کمی مهم هلو (prunus persica l.) یک تجزیه گسترده ژنومی فراآزمون qtl انجام پذیرفت. برای این منظور یک پایگاه داده حاوی دانسته‌های مربوط به نقشه‌یابی ژنتیکی بر پایه نشانگرهای مولکولی dna در جمعیت‌های مختلف هلو تشکیل شد. سپس یک نقشه ژنتیکی مرجع جدید بر پایه تابع نقشه کوسامبی ایجاد شد. بر اساس یافته‌های حاصل از این مطالعه تعداد 137 عدد qtl اولیه روی نقشه ژنتیکی مرجع پراکنش یافتند و در نهایت 22 mqtl در سطح ژنوم هلو و روی گروه‌های پیوستگی مختلف آن شناسایی شدند. در این میان گروه پیوستگی شماره 4 (lg4) دارای بیشترین تعداد mqtl بود. بر اساس تجزیه فراوانی هم‌مکانی بین qtlهای موجود در نواحی mqtlهای شناسایی شده، ویژگی زمان شکوفایی با 67% هم‌مکانی، دارای بیشترین هم‌مکانی از لحاظ qtl‌های موجود با ویژگی وزن میوه بود. نتیجه‌ها نشان داد که اثرهای پلیوتروپی و یا لینکاژ شدید بین ژن‌های کنترل‌کننده زمان گلدهی و وزن میوه در گیاه هلو وجود دارد. mqtlهای mqtl.lg4.3 و mqtl.lg4.2 با در برداشتن به ترتیب 14 و 10 عدد qtl در ناحیه ژنومی خود به عنوان قابل اعتمادترین و پایدارترین mqtlهای کنترل‌کننده ویژگی‌های کمی مختلف در هلو معرفی شدند.

Genome Wide Meta-QTL Analysis to Identify Stable Genomic Regions Associated with Important Quantitative Traits (QTLs) in Various Peach (Prunus persica L.) Populations

The metaQTL analysis was performed to identify the most effective and stable QTLs related to quantitative traits in peach (Prunus persica). In the present study, a QTL database containing information of molecular markers in different peach populations was constructed. Then, a new genetic consensus map based on the Kosambi map function was created. A number of 137 QTLs from the initial pool were projected in the constructed genetic consensus map and eventually 22 metaQTLs (MQTLs) on different linkage groups of the peach genome was detected. The linkage group 4 (LG4) had the highest number of MQTLs for the assessed traits. According to colocalization frequency analysis between existing QTLs in the detected MQTLs regions, blooming time had the highest colocalization (67%) with the QTLs of fruit weight. Pleiotropy or strong linkage between genes controlling blooming time and fruit weight could be explained for the colocalization of the tested traits. The MQTL.LG4.3 and MQTL.LG4.2 containing 14 and 10 QTLs in original genomic regions were identified as the most stable and reliable MQTLs controlling most of the traits tested in peach.