ژنو تایپینگ سویه های سالمونلا انتریتیدیس جدا شده از انسان و حیوانات در ایران با روش rep-pcr

مقدمه: سالمونلوز بیماری مشترک در انسان و حیوانات است. یکی از سرووارهای مهم از لحاظ بیمار یزایی در انسان، دام و طیور، سالمونلا انتریتیدیس است که عامل رایج بیماری های منتقله از طریق غذا نیز هستند. روش های مرسوم کشت ، بیوشیمیایی و سرولوژیکی نشان داده است که ارزش محدودیاز لحاظ آنالیز مولکولی و قدرت تفریق کمی دارند، ولی روش های تایپینگ مولکولی نظیر rep-pcr الگوهای dna برای تمایز و شناسایی سویه های سالمونلا ایجاد می کنند. هدف از این مطالعه تفریق و تمایز و تعیین قرابت بین جدایه های مختلف سرووار سالمونلا انتریتیدیس به وسیله روش انگشت نگاری مولکولی مبتنی برتوالی های تکرارشونده ( rep-pcr ) بود.روش بررسی: طی یک مطالعه مقطعی تعداد 64 جدایه سالمونلا انتریتیدیس از منابع مختلف )گاو، طیور و انسان( به وسیله روش انگش تنگاریمولکولی rep-pcr باپرایمرهای rep1r و rep2i بررسی شد و الگوی مولکولی قطعات dna براساس وجود یا غیاب باندها و اندازه آن ها در ژل الکتروفورزیس مشخص شد. با استفاده از برنامه کامپیوتری ntsys نمودار درختی یا دندروگرام ترسیم شد. یافته ها: تعداد 5 تا 14 باند با اندازه تقریبی 100 تا 3000 جفت باز (bp) با یک باند مشترک (400 bp) مشاهده شد. تعداد پروفایل مولکولی حاصل توسط پرایمرهای rep1r و rep2i در 64 جدایه سالمونلا انتریتیدیس در این تحقیق برابر با 38 پروفایل مولکولی بود که به سه خوشه (کلاستر) اصلی و پنج تحت خوشه (r3 ،r2a ،r2b ،r1 و r4) با 48 تا 81 درصد تشابه تقسیم شدند.شباهت بین جدایه های طیور و انسانی براساس دندروگرام بیشتر و حدود 72 تا 81 درصد بوده است. البته یک سویه گاوی به نام b13 دارای 82 درصد تشابه با سویه های انسانی مشاهده شد. نتیجه گیری: در این مطالعه rep-pcr قدرت تفریق بالایی در آنالیز سویه های سالمونلا انتریتیدیس نشان داده است. با استفاده از ضریب شانون-وینر(index shannon wiener) هتروژنیسیتی بالا (928/0) درجمعیت شامل 64 جدایه مختلف سالمونلا انتریتیدیس مشاهده شد. همچنین با توجه به نتایج کار مولکولی در این تحقیق سویه های سالمونلا انتریتیدیس جدا شده از طیور با سوی ههای جدا شده از انسان دارای تشابه بیشتر (به طور تقریبی 72 تا 81درصد) نسبت به سویه های گاوی (تشابه 48 درصد) هستند که بیانگر این موضوع است که از لحاظ اپیدمیولوژیکی احتمال خطر ابتلای موارد انسانی به سویه های سالمونلا انتریتیدیس با منشاء طیور بیشتر است.