بررسی اپیتوپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین g انسان به روش ایمونوانفورماتیک

سابقه و هدف: ایمونوگلوبولین g (igg) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و سطح igg سرم با شدت بیماریهایی مثل نقائص ایمنی، عفونتها و بیماریهای خود ایمنی ارتباط دارد. لذا igg ارزش تشخیصی بالایی دارد. ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخهای ایمنی وتشخیص دقیق تر بیماریها کمک می کند. این پژوهش با هدف تعیین اپی توپهای ایمونوژن خطی igg انسان با استفاده از ایمونوانفورماتیک انجام شد.روش بررسی: این مطالعه به روش توصیفی انجام شد. توالی و ساختار سوم igg مرجع انسان در پایگاه داده pdb(protein data bank)، ساختار دوم آن توسط نرم افزار phyre2(protein homology/ nalogy recognition engine v 2. 0) و اپی توپ های خطی آن توسط نرم افزارهای بیوانفورماتیکی ellipro و iedb) immune epitope database ) تعیین شدند.یافته ها: نرم افزار iedb، مهمترین اپی توپ های خطی igg انسان را در ناحیه بین اسید آمینه های 160 تا 175 در زنجیره سبک و 350 تا 360 در زنجیره سنگین تعیین کرد. 11 اپی توپ خطی توسط نرم افزار ellipro در دومینهای ثابت igg انسان ( یکی در ناحیه اتصالی به آنتی ژن (fab) و 10 اپی توپ دیگر در ناحیه ثابت (fc) در دومینهای ثابت 2 و 3 زنجیره سنگین (ch2 و (ch3 با توزیع مساوی) معرفی کرد. پنج اپی توپ شاخص تر در دومین ch3 واقع شده اند. نتیجه گیری: در این مطالعه تعداد قابل توجهی از اپی تو پهای خطی igg انسان با دو نرم افزار ایمونوانفورماتیکی شناسایی شدند که ابزارهای مناسبی برای تولید آنتی بادی های مونوکلونال اختصاصی شناسایی کننده igg، تعیین نقشه اپی توپ های igg، تولید کیت های تشخیص اختصاصی igg انسان و مطالعه های فیلوژنیک هستند. به نظر می رسد روش ایمونوانفورماتیک، ابزاری مفید برای تشخیص اپی توپ های خطی igg انسان است. انجام مطالعه های آزمایشگاهی برای تایید روشایمونوانفورماتیک در تعیین اپی توپ های خطی igg انسان مفید است.