تجزیه و تحلیل میکروبیوتای خون در سطح گونه در داوطلبان سالم در انستیتو پاستور تهران با استفاده از توالی یابی 16s rrna

سابقه و هدف: در مطالعه‌های پیشین اهمیت نقش میکروبیوتا به عنوان یک اکوسیستم در بدن انسان نشان داده شده است. مطالعه‌های اخیر وجود باکتری در خون افراد سالم را ارائه کرده است. مطالعه ما میکروبیوتای باکتریایی در خون انسان را از طریق توالی یابی ژن 16s rrna مشخص می‌کند. این مطالعه با برجسته کردن سویه‌های رشد یافته در محیط کشت، اهمیت انتخاب روش مطالعه را نشان می‌دهد.روش کار: مطالعه مورد نظر توصیفی بوده و براساس مطالعه‌های پیشین انجام شده، 50 نمونه خون از داوطلبان سالم برای این مطالعه جمع‌آوری شد. در این مطالعه منظور از انسان سالم، فردی است که شرایط زیر را دارا باشد: نبود بیماری‌های مزمن یا عفونت فعال. نمونه‌های خون در محیط مایع brain heart infusion (bhi) تحت شرایط کنترل شده کشت داده شدند. dna از کلنی‌های به دست آمده استخراج شد. ژن 16s rrna تکثیر و نتایج تکثیر در هر دو جهت توالی‌یابی شدند.یافته‌ها: از 50 نمونه خون (10درصد)، 5 نمونه رشد باکتریایی را نشان دادند. تمامی نمونه‌های دارای رشد باکتری از بین زنان 43-25 ساله بودند. تجزیه و تحلیل blast ایزوله‌های باکتریایی، وجود استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس (2 عدد) به ترتیب با درصد شباهت 97/7درصد و 97/78درصد، استافیلوکوکوس هومینیس (یک عدد) با 99/05درصد، گونه باسیلوس (یک عدد) با 98/62درصد، و باسیلوس سوبتلیس (یک عدد) با 91/28درصد شباهت را نشان داد.(0/05 < p-value). تجزیه و تحلیل آماری (آزمون دقیق فیشر) رابطه معناداری بین سن و سویه‌های باکتریایی جدا شده نشان نداد.نتیجه‌گیری: به نظر می‌رسد که این روش شناسایی گونه‌ها می‌تواند در اهداف تشخیصی مورد استفاده قرار گیرد. تحقیق‌های بیشتر را توصیه می‌کند.

species- level analysis of blood microbiota in healthy volunteers at the pasteur institute of tehran using 16s rrna sequencing

background and aim: the significance of the microbiota as an ecosystem in our bodies has been well established. recent studies have reported the presence of bacteria in the blood of healthy individuals. our study aims to characterize the bacterial microbiota in human blood through 16s rrna region sequencing. this study highlights the importance of method selection by focusing on the strains cultured in growth media.methods: this descriptive study collected 50 blood samples from healthy volunteers, following previous research protocols. in this study, a healthy individual is defined as someone who meets the following criteria: absence of chronic diseases or active infections. blood samples were cultured in the brain heart infusion (bhi) broth medium under controlled conditions. dna was extracted from the resulting colonies. the 16s rrna region was amplified, and amplicons were sequenced in both directions.results: five out of fifty (10%) blood samples exhibited bacterial growth. all samples with bacterial growth were from females aged 25-43 years. blast analysis of the bacterial isolates revealed staphylococcus epidermidis was identified in two samples with similarity percentages of 97.7% and 97.78%, respectively. staphylococcus hominis was detected in one sample with a similarity of 99.05%. additionally, a bacillus species was found in one sample with a similarity of 98.62%, and bacillus subtilis was identified in one sample with a similarity of 91.28%. statistical analysis using fisher’s exact test did not reveal a significant relationship between age and the isolated bacterial strains(p-value > 0.05).conclusion: it seems that this species identification method can be used for diagnosis purposes. it recommends further research