بررسی فراوانی جهش ژن thya و میزان مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید در سویه‌های بالینی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به دارو در شهر تهران در سال 1400-1397

سابقه و هدف: پیدایش مقاومت‌های دارویی و ظهور سویه‏های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مقاوم به درمان، کنترل این بیماری را با چالش مواجه ساخته است. بنا به آمار سازمان بهداشت جهانی (who)، سالانه در سراسر جهان حدود 000,500 مورد ابتلای جدید سل مقاوم به دارو گزارش می‏شود. با توجه به اینکه مکانیسم‏های مرتبط با بروز مقاومت‌های دارویی به درستی شناخته نشده است و تحقیق‌های مختلف نشان‏دهنده نتایج متفاوتی است، بر آن شدیم تا به بررسی جهش‏های ژن thya در ارتباط با مقاومت به داروی پارا- آمینوسالیسیلیک اسید (pas) بپردازیم.روش کار: در این مطالعه توصیفی- مقطعی، در مدت سه سال تعداد 255 نمونه‏ مثبت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس با استفاده از روش استاندارد کشت و اسمیر جداسازی شد، سپس با انجام آزمون حساسیت‏سنجی دارویی 68 نمونه سل مقاوم به دارو انتخاب شد. برای بررسی جهش‌های ژن‏ thya، از روش pcr استاندارد استفاده شد و قطعه‌های حاصله توالی‏یابی شدند. جهش‏های منجر به تغییر کدون، با به کارگیری نرم‏افزارهای پیش‏بینی تغییرهای پروتئین آنالیز شدند. ارتباط جهش‏های یافت ‏شده با مقاومت به داروی pas از لحاظ آماری توسط آزمون مربع کای مطالعه شد.یافته‌ها: از 255 نمونه مورد بررسی، 68 سویه (26/7درصد، فاصله اطمینان 21/3درصد) مقاوم به دارو تعیین شد. مجموعاً 13 نمونه (19/1درصد) سویه مقاوم به pas یافت شد که 5 سویه (38/4درصد) دارای جهش‌های نوکلئوتیدی مختلف در ژن thya بودند. از لحاظ آماری ارتباط جهش‏های مذکور با مقاومت آنتی‏بیوتیکی معنادار بود. به علاوه، نتایج آنالیز بیوانفورماتیک نشان داد که جهش‏های یافت‏شده منجر به اختلال در عملکرد و ناپایداری در ساختار پروتئین حاصله می‏شوند.نتیجه‌گیری: طبق نتایج به دست آمده به نظر می‏رسد که جهش‏ در ژن thya با مقاومت به داروی pas مرتبط است. همچنین یافته‏ها ارزش تشخیصی آنالیز قطعه‌های کوچک ژنومی و ابزارهای نوین بیوانفورماتیک را در شناسایی مکانیسم‏های مقاومت دارویی نشان می‏دهد.

frequency determination of thya mutations and prevalence of resistance to para- aminosalycylic acid in clinical strains of drug- resistant mycobacterium tuberculosis in tehran from 2018 to 2021

background and aim: the emergence of drug resistance and treatment- renitent mycobacterium tuberculosis has made controlling the disease a challenge. world health organization (who) estimates that approximately 500,000 new cases of tuberculosis occur annually. considering that mechanisms involved in drug resistance are yet to be elucidated and results of the studies are not consistent, we decided to investigate the correlation between mutations in thya gene and resistance to para- aminosalicylic acid (pas).methods: in this descriptive cross- sectional study, a total of 255 positive mtb specimens were isolated during a three- year period using standard microscopic and culture methods from which 68 multidrug resistant (mdr) and extensively drug resistant (xdr) tuberculosis samples were selected through drug susceptibility testing. then, to determine potential mutations in thya gene, the fragment was amplified using conventional pcr and products were sequenced. afterward, mutations which have been induced amino acid substitutions were evaluated with various protein prediction tools. also, the correlation between mutations and drug resistance was statistically determined using chi-square test.results: from 255 clinical tb samples, 68 (26.7%, ci 21.3%) mdr / or xdr-tb strains were isolated. in total, 13 (19.1%) were pas- resistant and 5 (38.4%) of them had different nucleotide mutations in thya gene. all of the mutations were statistically correlated with drug resistance. moreover, the results of bioinformatics showed that identified mutations could lead to the structural and functional disruption of the protein.conclusion: according to our results, mutations in thya gene have appeared to be associated with resistance to pas. also, our findings have shed light on the potential of the analysis of short genomic regions and new computational tools in unraveling the molecular mechanisms of drug resistance.