بررسی نقش پروموتوژن rit2 بر عملکرد قطعه ga repeat در بیماری پارکینسون

چکیده : تنظیم بیان ژن، توسط قطعه ای بنام پروموتر انجام می گردد که در بالادست ژن ها قرار گرفته است. گروهی از پروموترهای ژنهای کلاس ii فاقد هر گونه توالی حفاظت شده در توالی خود هستند و بررسی های بیوانفورماتیک نشان داده اند که فراوانی توالی های تکراری بلند، در این پروموتر ها بطور معنا داری بیشتر از پروموتر های دیگر می باشد. با توجه به شواهد عملکردی بودن و نیز ارتباط ژن rit2 با بیماری پارکینسون، در این مطالعه چند شکلی تکرار پروموتری این ژن در بیماری پارکینسون و نیز افراد نرمال، و همچنین اثر این تکرار بر بیان ژن مورد بررسی قرار گرفت. مواد و رو شها: این مطالعه شاهدی موردی و کاربردی است. مرحله اول مطالعه پلی مورفیسم قطعه تکرار ga ژن rit2 در 500 نمونه نرمال و 500بیمار پارکینسونی و در مرحله دوم، عملکرد قطعه تکرار ga ژن پروموتری ناحیه rit2 است که با استفاده از روش fisher exact test محاسبه 0.007 =p value( ( و تاثیر آن بر بیان ژن توسط تکنیک و روش کلونینگ بررسی شد.یافته ها: در بررسی پلی مورفیسم قطعه تکرار، هیچ تغییری در توالی تکرار مشاهده نشد و نشان داده شد که توالی مذکور در جمعیت انسانی تک شکل است. در بررسی اثر تعیین قطعه تکرار بر بیان ژن، مشاهده شد که میزان بیان ژن لوسیفراز در حضور قطعه تکرار در پروموتر، دو برابر میزان بیان در حالت فقدان قطعه تکرار در پروموترژن است.نتیجه گیری: با توجه به نقش عمده تکرار پروموتری ga ژن rit2 و از طرفی با توجه به نقش مهم این ژن در تکوین سلول های نورونی، هر گونه تغییری در این تکرار برای سلول قابل تحمل نبوده و سبب حفاظت قوی برای این قطعه تکرار شده است.

Analysis of polymorphism and function of GA repeat in RIT2 gene promoterAnalysis of polymorphism and function of GA repeat in RIT2 gene promoter in Parkinson’s disease

Background: Regulation of gene expression is performed by the promoter sequence resided upstream of genes. There are a group of class II gene promoters which lack any consensus sequences and bioinformatics studies have revealed that the frequency of exceptionally long repeats in these promoters are significantly more than other promoters. One of such promoters is the RIT2 gene promoter which includes an 11 GA repeat and its role in neurologic disorders such as Parkinson’s disease is the aim of this investigation. Materials and Methods: In this case control study we investigated the polymorphism of the GA repeat in 500 PD samples and 500 healthy controls, and also the role of the repeat sequence on gene expression using cloning technique. Results: We found that the GA repeat of the RIT2 gene shows monomorphism in human population. In expression study, we observed two fold expression level of luciferase in the presence of the GA repeat compared to its absence. Conclusion: Due to the important effect of the GA repeat in the RIT2 gene promoter and the important role of RIT2 gene in neuronal development, any alterations in repeat sequence is intolerable for cells and there is a strong conservation for this repeat.