بررسی حضور ژن‌های فیمبریل pap، sfa و fimh درجدایه‌های اشریشیاکلی مقاوم به ایمی پنم به دست آمده از بیماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراری در آزمایشگاه‌های شهر آمل در سال 1398-1397

سابقه و هدف: عفونت ادراری، یکی از شایع ترین عفونت های باکتریایی در جهان است. اشریشیاکلی یوروپاتوژنیک یکی از عوامل اصلی ایجاد این عفونت است. حضور ژن های فیمبریه، سبب چسبندگی باکتری به سلول های مجاری ادراری می شوند. هدف از این مطالعه، بررسی حضور 3 ژن فیمبریال papef، sfad وfimh در اشریشیاکلی جدا شده از بیماران مبتلا به عفونت دستگاه ادراری است. مواد و روش ها: در این مطالعه، توصیفی-مقطعی، 235 نمونه ادراری به صورت تصادفی از افراد مبتلا به عفونت دستگاه ادراری در سال 1397 تا 1398 از آزمایشگاه های شهر آمل جمع آوری شد. ابتدا هرکدام از نمونه ها به طور جداگانه روی محیط کشت ائوزین متیلن بلو (emb)کشت داده شدند و سپس توسط تست های بیوشیمیایی نظیر ، imvic، tsi و اوره آز بررسی شدند. در نمونه های مثبت از نظر حضور اشریشیاکلی تست آنتی بیوگرام برای ارزیابی حساسیت به آنتی بیوتیک ایمی پنم انجام شد. پس از استخراج dna از نمونه های مقاوم به ایمی پنم با روش جوشاندن، حضور ژن های فیمبریه papef، sfad وfimh توسط روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) بررسی شد. نتایج مطالعه با استفاده از نرم افزار spss نسخه 22 تجزیه و تحلیل شد. تجزیه و تحلیل آماری با استفاده از آزمون های manwhitney ، chisquare و با سطح معناداری 0.05< p انجام شد.نتایج: از 235 نمونه ادراری، تعداد 75 نمونه (31.9 درصد) حاوی باکتری اشریشیاکلی بودند. با استفاده از تست آنتی بیوگرام، تعداد 47 نمونه (62.7 درصد) از جدایه های اشریشیاکلی مقاوم به ایمی پنم تشخیص داده شدند. پس از انجام واکنش pcr، مشخص شد که تعداد 28 جدایه (59.6 درصد) از نظر حضور ژن fimh، هشت جدایه (17 درصد) از نظر حضور ژن papef و 19 جدایه (40.42 درصد) از نظر حضور ژن sfad مثبت بودند. نتایج نشان داد که در بین سویه های مطالعه شده، ژن fimh شایع ترین ژن کد کننده فیمبریه در اشریشیاکلی های جداشده از عفونت ادراری در شهر آمل بود. هرچند این یافته به لحاظ آماری معنادار نبود (0.05>p). همچنین در بررسی آماری نتایج مقاومت آنتی بیوتیکی و حضور ژن های حدت فیمبریال، هیچ ارتباط معناداری بین متغیرها (آنتی بیوتیک های مطالعه شده و ژن های حدت) مشاهده نشد (0.05>p).نتیجه گیری: به نظر می رسد ژن fimh شایع ترین ژن کد کننده فیمبریه در اشریشیاکلی های جداشده از عفونت ادراری در شهر آمل و عامل مهمی در بیماری زایی این باکتری است. بیشترین موارد ابتلا به عفونت ادراری، مرتبط با باکتری اشریشیاکلی حاوی ژن های نامبرده است، به همین دلیل تشخیص سریع آن ها در مبتلایان به عفونت ادراری می تواند به درمان سریع تر و بهتر مبتلایان کمک کند.

Evaluation of the presence of pap, sfa, and fimH genes in imipenemresistant Escherichia coli isolated from the patients with urinary tract infections from the laboratories of Amol in 20182019

Background: Urinary tract infection is one of the most common bacterial infections in the world and Europathogenic Escherichia coli is one of the main causes of this infection. The presence of fimbrial genes causes the bacteria to attach to the cells of the urinary tract. The aim of the present study was to evaluate the presence of 3 fimbrial genes papEF, sfaD, and fimH in Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections.Materials and methods: In the current crosssectional study, 235 urine samples were randomly collected from patients referred to different laboratories in Amol between 20182019. First, each sample was cultured separately on EMB agar and then analyzed using biochemical tests, such as IMViC, TSI, and urease. In positive samples for the presence of Escherichia coli, antibiogram test was performed to evaluate the sensitivity to the imipenem. After DNA extraction from imipenem resistant samples via boiling method, the presence of papEF, sfaD, and fimH genes was examined using Polymerase Chain Reaction (PCR). The results of the study were analyzed in SPSS, version 22. Statistical analyses were performed running ManWhitney and Chisquare tests with a significance level of P<0.05.Results: From among the 235 urine samples, 75 (31/9%) contained Escherichia coli bacteria. Also, 47 samples (62/7%) were detected from imipenemresistant Escherichia coli isolates. After PCR reaction, it was found that 28 isolates (59/6%) were positive for fimH gene, 8 isolates (17%) were positive for papEF gene, and 19 isolates (40/42%) were positive for sfaD gene. The results showed that, among the studied strains, fimH gene was the most common gene encoding fimbriae in Escherichia coli isolated from urinary tract infection in Amol city. However, this finding was not statistically significant (P <0.05). Also, in the statistical study of the results of antibiotic resistance and the presence of fimbrial virulence genes, no significant relationship was observed between the variables (P <0.05).Conclusion: It seems that fimH gene is the most common gene encoding fimbrial in Escherichia coli isolated from urinary tract infections in Amol city and is an important factor in the pathogenicity of this bacteria. Most cases of urinary tract infections are associated with Escherichia coli bacteria that contain these genes, so its early detection in patients with urinary tract infections can help treat patients in a faster and better way.