بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتیین تروپومیوزین کنه بوافیلوس

زمینه مطالعه: کنه بوافیلوس‌ ‌سبب انتقال برخی از اجرام پاتوژن و کاهش تولید در گاو می‌شود. پروتیین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بـوده و نقـش مهمـی در واکنش‌های ایمنی، آلرژی و تهیه واکسن دارد. هدف: روش‌های مرسوم شناسایی دقیق شاخص‌های آنتی ژنتیک (اپی توپ‌ها)، طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش‌های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ‌های احتمالی مورد شناسایی سلول‌ b و ‌+4tcd، مبتنی بر توالی و ساختار پروتیین می‌باشد. روش کار: از گستره وسیعی از برنامه‌ها و ابزارهای ایمونوانفورماتیک جهت آنالیز آنتی ژنسیتی، فراوانی ساختار ثانویه پروتیین و دومن‌ها، فاکتورهای فیزیکوشیمیایی مرتبط با مکان اپی توپ‌های خطی ،اپی توپ‌های سلول b، قطعات پپتیدی متصل شونده به آلل‌های mhc کلاس 2 گاو استفاده گردید. نتایج: آنالیز پروتیین با الگوریتم‌های مختلف و انتخاب‌ ‌اپی تـــوپ‌هـــای مـــورد تـــوافـــق در بـیـشـتــر ابــزارهــا مـنـجـر بـه بـه‌دسـت آمـدن سـه پپتیـد بـرگـزیـده بـا خـاصیـت اپـی تـوپـی بـرای سلـول b 80-62-eqlsqanskleekdkalqa-cooh) aa2(nh، 185-170-amveadleraeeraetg-cooh) aa2(nh و 218-200-vgnnlkslevseekalqkeet-cooh)aa2(nh ‌و یـــــــک پـــپـــتـــیـــــــد بــــــرای سلـــــول t 207-192-leeelrvvgnnlksl-cooh) aa2(nh گـردیـد. نتیجه گیری نهایی: جهت تحریک رضایت بخش سیستم ایمنی تنها قطعاتی از پـروتییـن (اپی توپ‌ها) کافی می‌باشد. انتخاب اپی توپ‌های بهینه سبب تمرکزپاسخ ایمنی و تهیه واکسن مناسب شده و از پاسخ‌های آلرژیک و نامطلوب می‌کاهد.