مطالعه چند شکلی های تک نوکلئوتیدی ناحیه مجتمع عمده پذیرش بافتی مرتبط به سیستم ایمنی در مرغ های تجاری گوشتی و تخم گذار

زمینۀ مطالعه: ناحیه  مجتمع عمده پذیرش بافتی (mhc) مرغ‌ها در صفات تولیدی، پاسخ‌های ایمنی، مقاومت به بیماری‌های عفونی و روابط فیلوژنتیکی، دارای اهمیت زیادی است. هدف: این تحقیق به منظور بررسی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی ناحیه ژنی mhc مرتبط به سیستم ایمنی در مرغ های تجاری گوشتی و تخم گذار انجام گرفت. روش‌کار: در این تحقیق یک‌صد نمونه خون از مرغ های تجاری گوشتی و تخم گذار اخذ و dna ی ژنومی به روش شستشوی نمکی استخراج شد. چند شکلی های آللی در جایگاه‌های ژنی bl، bf و bgبا استفاده از تکنیک pcrrflp و آنزیم msp i بررسی شد. نتایج: برای دو جمعیت تجاری گوشتی و تخم گذار برای جایگاه تکثیری 374 جفت بازی bl، تنها ژنوتیپ bb اما در جایگاه ژنی 1048 جفت بازی b-f، دو ژنوتیپ cg و gg فقط در مرغ های تجاری گوشتی شناسایی شد. در این جایگاه ژنی آلل c شامل باندهای 515، 410، 75 و 47 جفت بازی و آلل g دارای باندهای 410، 302، 213، 75 و 47 جفت بازی بودند. در جایگاه ژنی 401 جفت بازی b-g، سه ژنوتیپ mm، mn و nn و دو آلل m شامل یک باند 401 جفت بازی و آلل n دارای دو باند 350 و 51 جفت بازی مورد شناسایی قرار گرفت. در کل جمعیت ها، شاخص اطلاعات شانون در دو جایگاه ژنی bf و bg به ترتیب 0.45 و 0.73 و شاخص تثبیت به ترتیب 0.20 و 0.34 محاسبه شد. بیشترین مقدار شاخص هتروزیگوسیتی مشاهده ‌شده برای جایگاه های ژنی b-f و b-g به ترتیب 0.34 و 0.23 برآورد شد. نتیجه‌گیری نهایی:با توجه به تایید وجود چندشکلی در دو جایگاه ژنی b-f(در جمعیت مرغ تجاری گوشتی) و b-g(در جمعیت های مرغ های تجاری گوشتی و تخم گذار)، می‌توان از این جایگاه‌ها به ‌عنوان نشانگر ژنتیکی در برنامه های اصلاح نژادی جهت افزایش مقاومت به بیماری ها‌ استفاده کرد.

Study of Single Nucleotide Polymorphisms of Major Histocompatibility Complex Region Related to the Immune System in Commercial Broiler and Layer Chickens

BACKGROUND: Chicken major histocompatibility complex region (MHC) is important in the productive traits, immune responses, resistance to infectious diseases and phylogenetic relationships. OBJECTIVES: This study was investigated for single nucleotide polymorphisms of MHC region related to the immune system in commercial broiler and layer chickens. METHODS: One hundred blood samples were taken from commercial broiler and layer chickens and genomic DNA was extracted by salting out method. The allelic polymorphisms were investigated in BL, BF and BG loci using PCRRFLP and MspI enzyme. RESULTS: For two commercial broiler and laying populations, in the 374 bp locus of BL, only BB genotype was detected but in the 1048 bp locus of BF, two genotypes of CG and GG were identified in broiler chickens. The C allele contained four bands of 515, 410, 75 and 47 bp, and the G allele with five bands of 410, 302, 213, 75 and 47 bp. In BG (401 bp) locus, three genotypes of MM, MN and NN and two alleles of M with one band (401 bp) and N with two bands (350 and 51 bp) were identified. In total populations, the Shannon information index was calculated to be 0.45 and 0.73 in markers loci of BF and BG, and the fixation index values were 0.20 and 0.34, respectively. The highest observed heterozygosity index for BF and BG loci was 0.34 and 0.23, respectively. CONCLUSIONS: Considering the confirmation of the presence of polymorphism in two loci of the BF (in commercial broiler population) and BG (in commercial broiler and layer populations), these sites can be used as genetic marker in breeding programs to increase resistance to diseases.