|
|
ردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی جدایههای ایرانی fig badnavirus-1 بر اساس ژن تولید کننده آنزیم پروتیاز
|
|
|
|
|
نویسنده
|
علیشیری اطهر ,رخشنده رو فرشاد ,صالحی جوزانی غلامرضا ,شمس بخش مسعود
|
منبع
|
آفات و بيماريهاي گياهي - 1395 - دوره : 84 - شماره : 1 - صفحه:119 -130
|
چکیده
|
بادنا ویروس 1 انجیر (fig badnavirus -1) متعلق به خانواده caulimoviridae و جنس badnavirus بوده و یکی از شایعترین عوامل ویروسی همراه با بیماری موزاییک انجیر در انجیرکاریهای جهان میباشد. تعداد 392 نمونه برگی علایم دار و بدون علایم ویروسی از انجیر کاریهای نه استان کشور جمع آوری شد. نمونهها توسط آزمون سرولوژیکی dot immunobinding assay (diba) و با استفاده از آنتیسرم اختصاصی ویروس موزاییک انجیر مورد بررسی قرار گرفتند. وجود ویروس در نمونههای آلوده توسط آزمونهای مولکولی مورد تایید قرار گرفت. برای این منظور، dna کل از نمونههای آلوده استخراج و با استفاده از آغازگر اختصاصی برای ژن پروتیاز، قطعهای به طول تقریبی 1055 جفت باز تکثیر شد. پس از مشخص شدن توالی نوکلیوتیدی منطقه تکثیر شده نه جدایه fbv-1 مربوط به استانهای مختلف، توالیهای آنها با رس شمارهای ku314932-40 در بانک ژن ثبت شدند. نتایج همردیف سازی توالیها نشان داد جدایههای ایرانی در هر یک از سطوح نوکلیوتیدی یا اسید آمینهای به میزان 99-98% مشابه بودند. در بررسی تبارزایی بر مبنای توالی نوکلیوتیدی جدایههای مورد بررسی در دو گروه قرار گرفتند و جدایههای ایرانی مستقل از جدایه آمریکا در گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج این بررسی حاکی از حضور جمعیتهای متفاوت fbv-1 در ایران بود.
|
کلیدواژه
|
بادنا ویروس1 انجیر ,تبارزایی ,ردیابی
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, ایران, دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران, ایران, پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران, ایران, دانشگاه تربیت مدرس, ایران
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
Authors
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|