|
|
پردازش جهش ژن s (hbs ag) در مبتلایان به هپاتیت b مزمن و تعیین الگوی فرار ایمنی اکتسابی آنها
|
|
|
|
|
نویسنده
|
رضایی نیلوفر ,شاهسوندی شهلا ,سمیعی محمدرضا
|
منبع
|
مجله دانشكده پزشكي دانشگاه علوم پزشكي مشهد - 1399 - دوره : 63 - شماره : 1 - صفحه:2088 -2097
|
چکیده
|
مقدمه: سویه های جهش یافته مقاوم به آنالوگ های نوکلئوزیدی/نوکلئوتیدی ویروس هپاتیت b (hbv) در نتیجه طولانی شدن زمان مصرف و بروز پلیمرفیسم تک نوکلئوتیدی (snp) و جهش های گریز پدیدار می شوند. هدف از مطالعه حاضر، شناسایی فشارهای انتخابی و جهش فرار ایمنی در ژن hbsag (s) در بیماران مبتلا به hbv مزمن است.روش کار: در این مطالعه مقطعی که در سال 1397 در شهر کرج انجام شد، پنجاه بیمار مبتلا به هپاتیت b مزمن در دو گروه تحت درمان و بدون درمان دسته بندی شدند. تعداد کپی های dna ویروس هر بیمار با real time pcr برآورد شده و توالی ژن s تعیین شد. اثر هر snp بر پایداری پروتئین s با i-mutant و برآورد میزان انرژی آزاد ddg پیش بینی شد.نتایج: کمترین میزان بار ویروس و بیشترین آن به ترتیب 1^10 × 1/1 و ml/108 × 4/3 کپی برآورد شد. بیشترین تعداد جهش منجر به تغییر شامل q101r، t115n، s143l، و q129p در یک فرد با سابقه مصرف دارو تعیین شد. در یک بیمار بدون درمان، جهش های m133t و l175s مشاهده شد. جهش q129p، s174n و y134c نیز در افراد دیگر با سابقه درمان مشاهده شد. از مجموع 8 تغییر اسید آمینه، l175s با ddg برابر با kcal/mol 1/87- بیشترین اثر کاهشی را بر پایداری پروتئین s داشت.نتیجه گیری: براساس این دادهها، بین snp ژن s ویروس و پیدایش جهش گریز ارتباط وجود دارد. یافته های بررسی های جهشهای گریز میتواند بر بهبود درمان و ایمن سازی علیه عفونت مزمن هپاتیت b اثر گذار باشد.
|
کلیدواژه
|
عفونت مزمن هپاتیت b، جهش گریز، ژن s، پلی مرفیسم تک نوکلئوتیدی
|
آدرس
|
دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم تحقیقات تهران, ایران, سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی, ایران, سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی, موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
lotse_8000@yahoo.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
processing the mutation of the s gene (hbs ag) in patients with chronic hepatitis b and determining their acquired immunodeficiency pattern
|
|
|
Authors
|
rezaee niloufar ,shahsavandi shahla ,samiee mohammad reza
|
Abstract
|
introduction: the mutated strains resistant to nucleoside / nucleotide analogues of hepatitis b virus (hbv) appear as a result of prolonged use time and the occurrence of single nucleotide polymorphism (snp) and escape mutations. the aim of this study was to identify selective pressures and mutations in immune escape in the hbsag (s) gene in patients with chronic hbv. materials and methods: in this cross-sectional study conducted in 1397 in karaj, fifty patients with chronic hepatitis b were classified into two groups under treatment and without treatment. the number of dna copies of each patient's virus was estimated by real-time pcr, and the sequence of the s gene was determined. the effect of each snp on i-mutant protein stability and ddg free energy estimation was predicted. results: the lowest virus load and the highest were estimated to be 1.10 10 1.1 and 4.38 ml 10.3 ml, respectively. the highest number of mutations leading to the change, including q101r, t115n, s143l, and q129p, was determined in a person with a history of drug use. in one untreated patient, mutations in m133t and l175s were observed. mutations in q129p, s174n, and y134c were also observed in other individuals with a history of treatment. of the 8 amino acid changes, ld75s with ddg equal to kcal / mol 1.87 had the greatest effect on s protein stability. conclusion: based on these data, there is a relationship between snp virus s gene and mutant origin. findings from studies of escape mutations can be effective in improving treatment and immunization against chronic hepatitis b infection.
|
Keywords
|
chronic hepatitis b infection ,mutation ,s gene ,single nucleotide polymorphism
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|