تعیین فراوانی ژن‌های تولیدکننده کلیسین‌های ia و v در ایزوله‌های escherichia coli جدا شده از نمونه‌های بالینی مراکز درمانی شهر یزد

مقدمه: باکتریوسین‌ها پپتیدهایی با خاصیت ضد میکروبی می‌باشند. آن‎ها به صورت ریبوزومال سنتز شده و توسط هر دو گروه از باکتری‌های گرم مثبت و گرم منفی تولید می‌شوند. باکتریوسین‌های تولید شده توسط escherichia coli، کلیسین نام دارند. کلیسین‎ها در باکتری‎های کومنسال، مانع از رشد باکتری‎های پاتوژن می‎شوند و در سویه‎های پاتوژن باعث افزایش ویرولانس باکتری می‎گردند. هدف از مطالعه حاضر تعیین فراوانی ژن‌های col v و col ia در نمونه‌های escherichia coli جدا شده از بیماران با عفونت ادراری در شهر یزد است. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی - مقطعی، تعداد 160 جدایه escherichia coli از نمونه ادرار بیماران جدا شد و با آزمایشات بیوشیمیایی رایج شناسایی گردید. سپس واکنش pcr جهت بررسی فراوانی ژن‌های تولید‌کننده col v و col ia با استفاده از پرایمر‌های اختصاصی انجام شد و پس از تعیین توالی، نتایج با استفاده از نرم‌افزارversion 16  spssواکاوی گردید. نتایج: در این مطالعه از میان 160 جدایه escherichia coli مورد بررسی، ژن کلیسین در26/9 درصد از جدایه‌ها شناسایی شد. فراوانی ژن col ia (4/24درصد) و فراوانی ژن col v (6/10درصد) به‌دست آمد. هم‌چنین در 8/12 درصد از جدایه‎ها، هر دو ژن مورد بررسی با هم شناسایی گردید. فراوانی ایزوله‌هایی که فقط ژن col ia را داشتند، 16/2درصد و ایزوله‌هایی که فقط ژن col v را داشتند، 2/5 درصد بود. نتیجه‌گیری: در این بررسی، جدایه‌های دارای ژن col ia فراوانی بالایی را نشان دادند. اغلب سویه‌های دارای ژن col v، دارای ژن col ia نیز بودند. بنابراین ژن col v اغلب همراه ژن col ia مشاهده می‌شود.

determining the frequency of genes producing colicins ia and v in escherichia coli strains isolated from clinical samples of medical centers in yazd city

introduction: bacteriocins are peptides with antimicrobial properties. they are ribosomally synthesized and produced by both gram-positive and gram-negative bacteria. the bacteriocins produced by escherichia coli are called colicins. colicins in commensal bacteria inhibit the growth of pathogenic bacteria and in pathogen strains, they increase bacterial virulence. the aim of this study was to evaluate the frequency of col v and col ia genes in escherichia coli specimens isolated from patients with urinary tract infections in yazd city, iran. methods: in this descriptive cross-sectional study, 160 escherichia coli samples were isolated from urine specimens and identified by common biochemical tests. the amplification of col v and col ia genes was performed by pcr method using specific primers and after sequencing, the results were analyzed using spss version 16 software. results: in this study, out of 160 escherichia coli isolates examined, calicin gene was detected in 26.9% of the isolates. the frequency of col ia gene was 24.4% and the frequency of col v gene was 10.6%. furthermore, in 8.12% of isolates, both genes were identified together. the frequency of isolates containing only col ia gene was 16.2% and isolates containing only col v gene was 2.5%. conclusion: in this study, isolates with col ia gene showed high frequency. most strains with col v gene also had col ia gene. therefore, the col v gene is often observed together with the col ia gene.