تغییرات بیان ژن‌ foxe1 و lncrna ptcsc2 در بافت‌های توموری در مقایسه با بافت‌های سالم در بیماران مبتلا به سرطان کولورکتال

مقدمه: در مطالعات به متیلاسیون foxe1 در سرطان کولورکتال پرداخته شده و از آن به‌عنوان یک بیومارکر تشخیصی نام برده شده است. در این مطالعه برای اولین بار ارتباط بیانی foxe1 و lncrna ptcsc2 در سرطان کولورکتال و هم‌چنین مقایسه الگوی بیانی آن‌ها در دو بافت سالم و توموری افراد بیمار مورد مطالعه قرار گرفت.روش بررسی: در این تحقیق از 40 نمونه بافت بیمار مبتلا به سرطان کولورکتال و 40 بافت نرمال استفاده شد. سپس استخراج total rna و در ادامه سنتز cdna صورت گرفت. سپس میزان رونوشت اختصاصی ژن های lncrna ptcsc2 و foxe1 در دو بافت توموری و سالم مقایسه شد. نتایج حاصل به وسیله نرم افزار graphpad prism مورد تحلیل آماری قرار گرفت و جهت بررسی بیان lncrna ptcsc2 و foxe1 در گروه بیماران و سالم از آزمون ttest و نرم‌افزار پریزم استفاده شد و p کمتر از 0/05 به عنوان اختلاف معناداری در نظر گرفته شد.نتایج: سطح بیان foxe1 به‌طور معنی‌داری در نمونه‌های توموری کاهش نشان داد (0/005=p) درحالیکه سطح بیان lncrna ptcsc2 در بافت توموری در مقایسه با بافت نرمال تغییر چشمگیری نداشت (0/65=p). به علاوه سطح بیان foxe1 و lncrna ptcsc2 ارتباط معناداری با پیشرفت بیماری و سن بیماران نشان نداد. نمودار roc نشان داد که ژن foxe1 می‌تواند به عنوان یک متغیر مستقل به صورت نسبتاً مناسبی (0/03p=) میان دو گروه بافت سالم و بیمار مورد مطالعه تغییرات بیانی داشته باشد. نتیجه‌گیری: با توجه نتایج این مطالعه، تغییرات بیان ژن foxe1 در نمونه های توموری کاهش چشمگیری داشت و در سرطان کولورکتال می تواند به عنوان یک بیوماکر برای تشخیص تومور مورد استفاده قرار گیرد.

Expression Changes of the FOXE1 and lncRNA PTCSC2 Expression in Tumor Tissues Compared with Normal Tissues in Patients with Colorectal Cancer

Introduction: In recent studies, methylation of FOXE1 in colorectal cancer has been reported as a diagnostic biomarker. In this study for the first time, the expression of FOXE1 and PTCSC2 in colorectal cancer was investigated and their expression patterns in two healthy and tumor tissues of patients were compared.Methods: In this study, 40 tumor tissues with colorectal cancer and 40 adjacent normal samples were collected. Total RNA was extracted and cDNA synthesis followed. Then, the specific genes for lncRNA PTCSC2 and FOXE1 were amplified. The results were statistically analyzed by Graph Pad Prism software and a Ttest was used to compare the expression levels of lncRNA PTCSC2 and FOXE1 in the patients and healthy group; pvalue less than 0.05 was considered significant difference criteria.Results: In this study, the FOXE1 expression level was significantly decreased in tumor tissue (pvalue = 0.005), whereas the lncRNA PTCSC2 expression level in tumor tissue was not significantly changed (pvalue = 0.65). In addition, the expression levels of FOXE1 and lncRNA PTCSC2 did not show a significant relation with disease progression and age of the patients. ROC curve for changes in FOXE1 and lncRNA PTCSC2 expression showed that theFOXE1 gene could be a relatively appropriate independent variable (pvalue = 0.03) to differentiate between the two study groups.Conclusion: According to the results of this study, changes in FOXE1 gene expression were significantly reduced in tumor samples and can be used as a biomarker in tumor diagnosis in colorectal cancer.