بررسی الگوی متیلاسیون ناحیه پروموتری ژن گاماگلوبین در ناقلین و بیماران مبتلا به تالاسمی بتا با هموگلوبین جنینی بالا در مقایسه با افراد طبیعی

مقدمه: از عواملی که احتمالاً با بیان مجدد ژن گاما‌گلوبین در بزرگسالی مرتبط است تغییر الگوی متیلاسیون ناحیه پروموتری آن است. هدف از این مطالعه تعیین میزان همراهی الگوی متیلاسیون پروموتر ژن گاماگلوبین با میزان بیان این ژن در بیماران و ناقلین بتا تالاسمی است.روش بررسی: در این مطالعه که به‌صورت موردی - شاهدی انجام گرفته است. بعد از گرفتن نمونه خون از 30 بیمار و ناقل تالاسمی بتا‌گلوبین با هموگلوبین جنینی بالا و 30 فرد نرمال استخراج dna انجام گردید. سپس نمونه‌های dna با سدیم بیسولفیت تیماره شده، 6 جایگاه cpg در محدوده پروموتر و اگزون 1 ژن گاماگلوبین به روش bisulfite sequencing analysis مورد بررسی قرار گرفت. از آزمون آماری ttest استفاده گردید. مقدار p کمتر از 0/05 به معنای اختلاف معنی‌دار بین دو گروه انتخاب شد. داده‌ها به وسیله نرم‌افزار spss version 16 تجزیه و تحلیل شد.نتایج: در این بررسی هایپومتیله بودن ناحیه پروموتری ژن گاما‌گلوبین نمونه‌های بیماران و ناقلین در مقایسه با نمونه‌های نرمال تفاوت معنی‌داری در سه جایگاه 6+ ،+53 و 162 مشاهده شد (0/05 >p). به‌علاوه در سه نمونه، موقعیت 162 دارای وضعیت نیمه متیله بود که این وضعیت به‌طور واضحی متفاوت از دیگر نمونه‌های بیمار و نرمال بود. نتیجه‌گیری: هایپومتیلاسیون پروموتر ژن گاماگلوبین احتمالا عامل کمکی در افزایش هموگلوبین جنینی است.

Analysis of Methylation Status in Promoter Region of Γ- Globin Gene in Carrier and Affected Β-Thalassemia Patients with High Level of Fetal Hemoglobin in Comparison with Normal Individuals

Introduction: Among the factors that may be associated with the reexpression gammaglobin in adults is the methylation pattern of the promoter region. The study aimed to determine the association between promoter methylation pattern of the gammaglobin gene in the carriers and affected betathalassemia individuals and its expression levels.Methods: This study has been done as a case control study. After taking blood samples from 30 patients and betathalassemia carriers and affected patients with fetal hemoglobin elevated as well as 30 normal individuals, genomic DNA was extracted. Six CpG sites of the promoter region and exon1 of the gammaglobin gene were analyzed by the bisulfite sequencing analysis method. Statistical analysis was carried out using a ttest. The values of p le; 0.05 were considered significant for comparing two studied groups. Data were analyzed using SPSS version 16 software.Results: In this study, hypomethylation of the gammaglobin promoter region in the patients and carriers compared to showed a significant differences in three CpG sites +6, 53 and 162, respectively (p<0.05). In addition, in three cases, CpG site in position 162 was semi methylated; this situation was markedly different from other samples of the patients and normal cases.Conclusion: Hypomethylation of the gammaglobin gene promoter probably has an auxiliary role in fetal hemoglobin increase.