isolation, molecular identification and genomic pattern of mycobacterium bovis isolates collected from tuberculin-positive cattle in infected farms of shiraz, iran

Background mycobacterium bovis is the main cause of tuberculosis in cattle. the most commonly used method to identify bovisinfected cattle is tuberculin test. objective the present study aimed to investigate the population structure of mycobacterium bovis in infected cattle farms of shiraz city in iran.methods in this descriptive crosssectional study, 50 pathological samples from tuberculinpositive cattle that were collected from two abattoirs were cultured on glycerinated and pyruvated lowensteinjensen media. genomic material from culturepositive slopes was extracted and used in polymerase chain reaction (pcr)16s rrna, pcris6110, and pcrregions of difference (rd) typing. all the m. bovis isolates were then digested by pvuii restriction enzyme and genotyped by polymorphic guanine/cytosinerich repetitive sequences (pgrs)restriction fragment length polymorphism (rflp) technique.findings in bacterial culture, 13 (26%) of samples had living mycobacteria where pcr test results revealed their identity as mycobacterium bovis. genotype profiling by rflppgrs method displayed two patterns with 10 isolates shared a single profile identical to that of m. bovis bacillus calmetteguerin (bcg) strain (1173 p2) and three isolated with a different genotype.conclusion higher prevalence of bcglike m. bovis (as a typical characteristic of iranian m. bovis population) in cattle farms of shiraz city was expected. this may indicate the local evolution of new m. bovis strains in the region or the infiltration of such strains through cattle farming activities.

جداسازی، شناسایی مولکولی و تهیه الگوی ژنومی جدایه‌های مایکوباکتریوم بوویس جدا‌شده از گاوهای توبرکولین مثبت در دامداری‌های آلوده شیراز

زمینه عامل اصلی سل در گاو، مایکوباکتریوم بوویس است. متداول‌ترین روش در حال استفاده جهت شناسایی گاوهای آلوده، در مقیاس جهانی و همچنین در ایران، تست توبرکولین است. هدف مطالعه حاضر با هدف بهبود دانش ما از ساختار جمعیت مایکوباکتریوم بوویس‌های جدا‌شده در گاوداری‌های شیراز صورت پذیرفت.مواد و روش‌ها در این مطالعه مقطعی ـ توصیفی که بین دی ۱۳۹۴ تا بهمن ۱۳۹۵ انجام شد، ۵۰ نمونه پاتولوژیک جمع‌آوری‌شده از گاوهای توبرکولین مثبت، از دو کشتارگاه در شیراز، بر روی محیط لونشتاین جانسون گلیسیرینه و پیرواته کشت داده شدند. استخراج ژنوم از کشت‌های مثبت انجام شد و از آن‌ها در آزمون‌های PCR۱۶SrRNA ،PCRIS۶۱۱۰، و PCRRD Typing استفاده شد. تمام جدایه‌های مایکوباکتریوم بوویس با استفاده از هضم آنزیمی با آنزیم pvu II و روش PGRSRFLP مورد ژنوتایپینگ قرار گرفتند.یافته‌ها در کشت باکتریایی، درمجموع ۱۳ نمونه (۲۶ درصد) حاوی مایکوباکتریوم زنده بودند که با استفاده از آزمون‌های PCR، هویت همه جدایه‌ها به عنوان مایکوباکتریوم بوویس تأیید شد. ژنوتایپینگ با استفاده از روش PGRSRFLP، دو الگو را نشان داد که ۱۰ جدایه ژنوتیپ مشابه و سه جدایه ژنوتیپ متفاوتی با سویه مایکوباکتریوم بوویس GCB (۱۱۷۳ P۲) داشتند. نتیجه‌گیری در حالی که تداوم مایکوباکتریوم بوویس شبه BCG (به عنوان یک ویژگی معمول در جمعیت مایکوباکتریوم بوویس ایرانی) در گاوداری‌های شیراز تعجب‌آور نیست، ممکن است که شناسایی یک سویه بسیار مشابه در کار ما بتواند نشان‌دهنده تکامل موضعی سویه‌های جدید مایکوباکتریوم بوویس در منطقه یا نفوذ چنین سویه‌هایی از طریق فعالیت‌های دامپروری باشد.