|
|
همراهی چندشکلی ژن ercc5 (rs1047768 ) با استعداد ابتلا به سرطان پستان در شمالغرب ایران
|
|
|
|
|
نویسنده
|
شاه عباسی ندا ,غفاریان سارا
|
منبع
|
زيست شناسي كاربردي - 1403 - دوره : 37 - شماره : 4 - صفحه:65 -74
|
چکیده
|
مقدمه: ترمیم برش نوکلئوتیدی (ner) یک مکانیسم کلیدی ترمیم dna است و ژن ercc5 یکی از اجزای کلیدی این مسیر، یک اندونوکلئاز ویژه با ساختار 1168 آمینواسیدی را کد میکند. در این مطالعه همراهی چندشکلی rs1047768 t>c ژن ercc5 با استعداد ابتلا به سرطان پستان در زنان شمال غرب ایران مورد بررسی قرار گرفت.روشها: در این مطالعه مورد شاهدی، همراهی چندشکلی rs1047768 t>c ژن ercc5 با استعداد ابتلا به سرطان پستان در جامعه آماری متشکل از 100 زن بیمار و 100 فرد سالم با تکنیک tetra arms pcr مورد بررسی قرار گرفت. تجزیه و تحلیل دادههای حاصل با استفاده از برنامهی آماری آنلاین javastat و نرمافزار spss نسخهی 26 انجام شد.نتایج: فراوانی ژنوتیپهای cc ، tc و tt در بیماران به ترتیب 26.43، 44.83 و 28.73 درصد و فراوانی آنها در افراد سالم به ترتیب 24.44، 15.55 و 60 درصد بود. تجزیههای آماری نشان دهنده همراهی معنیدار ژنوتیپهای tt (0.001 =p value) (0.503 0.144=, ci 95% 0.269=or) و tc با سرطان پستان (0.001 =p value) (8.967 2.169=, ci 95% 4.411/0=or) بود. فراوانی آللهای c و t در بیماران به ترتیب 48.85 و 51.14 درصد بود. در جمعیت کنترل فراوانی آللهای c و t به ترتیب 32.22 و 67.77 درصد بود. نتایج حاصل نشان دهنده همراهی فراوانی دو آلل t (0.001 =p value) و c (0.001 =p value) با ریسک ابتلا به سرطان پستان بود. همراهی ویژگیهای پاتولوژیکی افراد بیمار با توزیع ژنوتیپی این snp معناداری نبود.بحث: براساس نتایج این چندشکلی میتواند باعث افزایش ریسک ابتلا به سرطان پستان در شمال غرب ایران شود.
|
کلیدواژه
|
ترمیم برش نوکلئوتیدی، چند شکلی تک نوکلئوتیدی، ژن xpg، مطالعه مورد شاهدی، ویژگیهای بالینی
|
آدرس
|
دانشگاه شهید مدنی آذربایجان, ایران, دانشگاه شهید مدنی آذربایجان, دانشکده علوم پایه, گروه زیست شناسی, ایران
|
پست الکترونیکی
|
saraghaffarian86@gmail.com
|
|
|
|
|
|
|
|
|
association between ercc5 gene polymorphism (rs1047768) and the risk of breast cancer in northwest of iran
|
|
|
Authors
|
shahabbasi neda ,ghaffarian sara
|
Abstract
|
introduction: nucleotide excision repair (ner) is a key mechanism in dna repair, and the ercc5 gene, is one of the key components of this pathway, which encodes a special endonuclease with 1168 amino acids. in this research we studied the association of rs920778 c>t single nucleotide polymorphism of ercc5 gene with the risk of breast cancer in northwest iran.material and methods: in this case control study, the association of ercc5 (rs920778 c>t) gene polymorphism with breast cancer susceptibility was studied in a statistical population consisting of 100 patients and 100 healthy controls by tetra arms pcr. statistical analysis was performed using javastat online statistics package and spss v.26.results: in the case group, the frequency of cc, ct, and tt genotypes were 26.43%, 44.83%, and 28.73%, respectively and they were 24.44%, 15.55%, and 60% for the control group. statistical analysis showed a significant association between tt genotype (p value=0.000) (or=0.269, ci 95%=0.144 0.503) and ct genotype (p value=0.000) (or=4.411, ci 95%=2.169 8.967) with breast cancer risk. also, c and t allele frequency in case group, was 48.85% and 51.14% and them in the control group were 32.22% and 67.77% respectively. there was a significant association between t (p value=0.001) and c (p value=0.001) allele frequency and breast cancer risk in northwestern iran. there was no significant association between this snp frequency and patient’s pathological traits.conclution: these findings suggest that this snp may contribute to the susceptibility of breast cancer in northwestern iran.
|
Keywords
|
case-control study ,nucleotide excision repair ,pathological traits ,single nucleotide polymorphism ,xpg gene
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|